دانلود مقالات ISI درباره نمونه گیری پیشرفته + ترجمه فارسی

پتانسیل کارآمد محاسبه میانگین نیرو از طریق شبیه سازی چندسطحی: قرار دادن حل در یک غشای چربی

Efficient potential of mean force calculation from multiscale simulations: Solute insertion in a lipid membrane

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Multiscale simulations; Drug-membrane systems; Potential of mean force; Enhanced sampling; DMPC; 1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine; DOPC; 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine; POPC; 1-palmitoyl-2-oleoylphosphatidylcholine; MD; molecular dyna

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

چندگانه تقسیم کننده برای نمونه برداری با روش های مونت کارلو همیلتون متداول

Multi-stage splitting integrators for sampling with modified Hamiltonian Monte Carlo methods

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Hamiltonian Monte Carlo; Modified Hamiltonian; Multi-stage integrators; Enhanced sampling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 34 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

تسریع پروتئین سریع تر با استفاده از نمونه گیری غلطکی از شبیه سازی دینامیک مولکولی

Faster protein folding using enhanced conformational sampling of molecular dynamics simulation

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Protein folding; Enhanced sampling; Molecular dynamics; Swarm particle dynamics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 67 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

استراتژی های اکتشاف مناظر انرژی آزاد: اتحاد در تنوع و چالش های پیش رو

Strategies for the exploration of free energy landscapes: Unity in diversity and challenges ahead

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Activated processes; Rare events; Free energy landscapes; Enhanced sampling; Molecular dynamics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 17 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

انتشار لیگاندها در پروتئین ها با استفاده از نمونه گیری پیشرفته در پویایی مولکولی

Ligand diffusion in proteins via enhanced sampling in molecular dynamics

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Ligand diffusion; Biological transport; Molecular dynamics; Enhanced sampling; Reaction coordinates; Free energy;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 37 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

مطالعات محاسباتی حمل و نقل در کانال های یونی با استفاده از متادینامیک

Computational studies of transport in ion channels using metadynamics

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; MD; molecular dynamics; CV; collective variable; WTMetaD; well-tempered metadynamics; BE-META; bias-exchange metadynamics; US; umbrella sampling; Membrane proteins; Free energy; K+ channels; Na+ channels; Enhanced sampling; Molecular dynamics; Simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 28 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

دینامیک مولکولی و شبیه سازی مونت کارلو برای طراحی پروتئین-لیگاند و مهار کننده

Molecular dynamics and Monte Carlo simulations for protein-ligand binding and inhibitor design

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Non-nucleoside inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase; Replica exchange with solute tempering; Free energy perturbation; Enhanced sampling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

تکنیک های نمونه گیری پیشرفته در شبیه سازی سیستم های بیولوژیکی پویایی مولکولی

Enhanced sampling techniques in molecular dynamics simulations of biological systems

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Enhanced sampling; Molecular dynamics; Replica-exchange molecular dynamics; Metadynamics; Generalized simulated annealing; Cellulosome;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

نگاهی به هسته سازی بلورهای اوره از ذوب

Insight into the nucleation of urea crystals from the melt

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Urea; Molecular dynamics; Nucleation; Free energy; Enhanced sampling; Well tempered metadynamics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

به سوی نمونه برداری سریع، دقیق و کارآمد از بیومولکول ها: پیشرفت در دینامیک مولکولی شتاب

Towards fast, rigorous and efficient conformational sampling of biomolecules: Advances in accelerated molecular dynamics

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Accelerated molecular dynamics; Enhanced sampling; Protein folding; Trp-cage; Villin headpiece; Chignolin;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

یک پروتکل شبیه سازی مولکولی برای جلوگیری از افزونگی نمونه برداری و کشف حالت های جدید

A molecular simulation protocol to avoid sampling redundancy and discover new states

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; CLD; Cartesian Langevin dynamics; CS; canonical sampling; MC; Monte Carlo; MD; molecular dynamics; MSM; Markov state model; PCA; principal component analysis; PES; potential energy surface; PIGS; Progress Index-Guided Sampling; REX; replica exchange; RMSD

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

اجرای نمونه ای از روش نمونه گیری تصفیه یکپارچه برای افزایش نمونه گیری در طیف گسترده ای از درجه حرارت

Facile implementation of integrated tempering sampling method to enhance the sampling over a broad range of temperatures

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Enhanced sampling; Molecular simulation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Understanding the core of RNA interference: The dynamic aspects of Argonaute-mediated processes

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Argonaute; RNA interference; Mechanism; Kinetics; Protein motions; Molecular dynamics simulation; Protein-DNA/RNA docking; Markov-state-models; Enhanced sampling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Metadyn View: Fast web-based viewer of free energy surfaces calculated by metadynamics

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Free energy; Molecular dynamics; Enhanced sampling; Web-based visualization;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Influence of the ionic liquid [C4mpy][Tf2N] on the structure of the miniprotein Trp-cage

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Molecular dynamics; Ionic liquids; Protein folding; Enhanced sampling; Trp-cage;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

PLUMED 2: New feathers for an old bird

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Free energy; Molecular dynamics; Enhanced sampling; Dimensional reduction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Mixed Monte Carlo/Molecular Dynamics simulations of the prion protein

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Monte Carlo; Molecular Dynamics; Enhanced sampling; GROMACS; Prion misfolding

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

The HSP90 binding mode of a radicicol-like E-oxime determined by docking, binding free energy estimations, and NMR 15N chemical shifts

Keywords: نمونه گیری پیشرفته; Heat shock protein; Macrolide; Enhanced sampling; Flexible ligand docking; Binding mode evaluation; In silico drug design;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2009 سفارش ترجمه