کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10822579 1061667 2013 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Modeling protein association mechanisms and kinetics
ترجمه فارسی عنوان
مدل سازی مکانیسم های ارتباط پروتئین و سینتیک
ترجمه چکیده
پیشرفت های قابل توجهی در مدل سازی سازه های پروتئین و در محاسبه ثابت ارتباط انجمن (کا) صورت گرفته است. در حال حاضر درک روشنی از عوامل فیزیکی که طیف گسترده ای از ارزش های آزمایشگاهی را در بر می گیرند، درک می کنیم. نیمی از مشکل ارتباطی که کا کا محدود شده توسط انتشار است، شاید حل شود، و برای نیمه دیگر، که در آن تغییرات سازمانی به میزان محدود تبدیل می شوند، برای محاسبات، تعدادی از روش های امیدوار کننده در حال توسعه هستند. به طور قابل توجهی، کینتیک های اتصال پروتئین های اختلال توجه بیشتری را به خود جلب می کنند و "مکانیک سازی" به عنوان یک مکانیسم کلی شکل می گیرد. پیشرفت در مدل سازی پروتئین های پروتئین در شرایطی که تقارن محیط های ناهمگن و شلوغ سلول ها را ایجاد می کند، تلاش می کند که در نهایت منجر به درک بهتر توابع سلولی شود.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Substantial advances have been made in modeling protein association mechanisms and in calculating association rate constants (ka). We now have a clear understanding of the physical factors underlying the wide range of experimental ka values. Half of the association problem, where ka is limited by diffusion, is perhaps solved, and for the other half, where conformational changes become rate-limiting, a number of promising methods are being developed for ka calculations. Notably, the binding kinetics of disordered proteins are receiving growing attention, with 'dock-and-coalesce' emerging as a general mechanism. Progress too has been made in the modeling of protein association kinetics under conditions mimicking the heterogeneous, crowded environments of cells, an endeavor that should ultimately lead to a better understanding of cellular functions.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 23, Issue 6, December 2013, Pages 887-893
نویسندگان
, ,