Protein-protein interaction networks: the puzzling riches

در حالی که پیشرفت های عمده ای در تکنیک های تجربی مورد استفاده برای تشخیص تعاملات پروتئینی و در پردازش و تجزیه و تحلیل مقدار گسترده ای از داده ها که آنها تولید می شود، هنوز درک نمی کنیم که چرا مجموعه ای از تعاملات مشخص شده باقی می ماند بسیار وابسته به روش تشخیص خاص. در اینجا ما یک مرور کلی از روشهای بزرگ تجربی با کارایی بالا برای تشخیص تعاملات و مجموعه داده های تولید شده با استفاده از این روش ها در 10 سال گذشته ارائه می کنیم. ما چالش های ارزیابی کیفیت این مجموعه داده ها را مورد بحث قرار می دهیم و عوامل کلیدی را بررسی می کنیم که احتمالا همپوشانی نامطلوب دائمی بین تعاملات شناسایی شده توسط روش های مختلف را زیر سؤال می برند. در نهایت، ما یک مروری کوتاه از داده های متقابل پروتکل اداره شده که در پایگاه داده های عمومی نگهداری می شوند ارائه می کنیم، که اغلب برای تأیید مستقل شبکه های تعامل جدید ایجاد شده است.