کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10822586 1061667 2013 10 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Evolution of protein structures and interactions from the perspective of residue contact networks
ترجمه فارسی عنوان
تکامل ساختارهای پروتئین و تعاملات از دیدگاه شبکه های تماس با باقی مانده
ترجمه چکیده
در اینجا ما مکانیزم های تکامل پروتئین را که منجر به تغییرات ساختاری در پروتئین های پروتئینی می شود بررسی می کنیم این مکانیسم ها شامل جهش هایی هستند که به طور مستقیم در میان پروتئین های پروتئینی و همچنین اثرات جهش هایی که از مناطق دور از پروتئین پخش می شوند، می باشد. ما همچنین در مورد محدودیت ها، ساختارهای پیچیده پروتئین بر تکامل دنباله بحث می کنیم. ما این مکانیزم ها را با استفاده از شبکه های تماس با باقیمانده اسید آمینه تفسیر می کنیم. بسیاری از بینش های مربوط به تکامل پروتئین از مطالعات مونومرها می آید و این نتایج ما را در درک تکامل پروتئین های پیچیده تسهیل می کند. در نهایت، ما توان بالقوه رسمی سازی چارچوب فیلوژنتیک را برای ادغام تکامل باقی مانده، تکامل ساختار و تغییر تعداد شبکه های تماس با باقی مانده در خانواده های پروتئین را مشخص می کنیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
پیش نمایش مقاله
تکامل ساختارهای پروتئین و تعاملات از دیدگاه شبکه های تماس با باقی مانده
چکیده انگلیسی
Here we review mechanisms of protein evolution leading to structural changes in protein complexes. These mechanisms include mutations directly within protein interfaces, as well as the effects of mutations that propagate from distant regions of the protein. We also discuss the constraints protein complex structures impose on sequence evolution. We interpret, wherever possible, these mechanisms using amino acid residue contact networks. Many insights into protein evolution come from studies of monomers, and these results facilitate our understanding of evolution of protein complexes. Finally, we highlight the potential of formalizing a phylogenetic framework to integrate residue evolution, structure evolution, and to quantify changes in residue contact networks in protein families.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 23, Issue 6, December 2013, Pages 954-963
نویسندگان
, , ,