کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10825865 1064681 2013 12 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Perspectives for identification of mutations in the zebrafish: Making use of next-generation sequencing technologies for forward genetic approaches
ترجمه فارسی عنوان
چشم انداز شناسایی جهش در ماهی قزل آلا: استفاده از تکنولوژی توالی نسل بعدی برای رویکردهای ژنتیکی پیش رو
کلمات کلیدی
ماهی قزل آلا، توالی انتخاب ژنوم کل، نقشه برداری جهشی، تجزیه و تحلیل جدی هومیوژگتیس به ندرت،
ترجمه چکیده
توانایی تشخیص جهش فنوتیپ باعث استفاده از صفحه نمایش های جهش در بسیاری از ارگانیسم های حیاتی می شود. جهش های نقشه برداری برای مدت زمان طولانی تنگنا در تحقیق ژرفا بود، به عنوان روش استاندارد برای نقشه برداری و شناسایی جهش ها وقت گیر و گران بود. توسعه تکنولوژی توالی جدید در دو سال گذشته توالی سریع و مقرون به صرفه ژنوم کل را فعال کرده است. این امر منجر به ایجاد استراتژی های جدید برای شناسایی و شناسایی جهش در چندین ارگانیسم مدل شده است. استفاده از این تکنیک ها به مدل ژیروسکوپ، با ژنوم بزرگ آن و سطح بالایی از تغییرات در میان گونه ها، بی اهمیت بود. اخیرا تکنیک های متعددی به کار گرفته شده است که ویژگی های خاص ژنوم زبرا ماهی را در نظر گرفته اند. در اینجا ما خلاصه ای در مورد چگونگی برنامه ریزی یک آزمایش نقشه برداری، جزئیات پارامترهای بحرانی و بحث در مورد ابزارهای موجود برای نقشه برداری و شناسایی جهش های ماهی قزل آلا با استفاده از توالی نسل بعدی ارائه می دهیم. با استفاده از این روش ها، جهش های زبرا ماهی در حال حاضر می توانند در چند هفته برای کسری از هزینه ها نقشه برداری شوند. افزایش بهره وری شناسایی جهش در ماهی قزل آلا گسترش استفاده از مدل و اجازه می دهد تا برای تجزیه و تحلیل سیستماتیک از عملکرد ژن در یک مدل مهره دار.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
پیش نمایش مقاله
چشم انداز شناسایی جهش در ماهی قزل آلا: استفاده از تکنولوژی توالی نسل بعدی برای رویکردهای ژنتیکی پیش رو
چکیده انگلیسی
The ability to identify a phenotype causing mutation is essential for successful use of mutagenesis screens in many model organisms. Mapping mutations was for a long time a bottleneck in zebrafish research, as the standard method for mapping and identification of mutations was time consuming and expensive. The development of new sequencing technologies in the last couple of years has enabled the rapid and cost-effective sequencing of whole genomes. This has led to the establishment of new strategies for mapping and identification of mutations in several model organisms. The application of these techniques to the zebrafish model, with its large genome and the high level of variation in and between strains, was not trivial. Several techniques have been developed recently, taking the specific characteristics of the zebrafish genome into account. Here we give an overview on how to plan a mapping experiment, detail the critical parameters and discuss available tools for mapping and identification of mutations in zebrafish using next-generation sequencing. Using these methods, zebrafish mutants can now be mapped in a couple of weeks for a fraction of the costs. The increased efficiency of identification of mutations in the zebrafish broadens the utility of the model and allows for systematic analysis of gene function in a vertebrate model.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 62, Issue 3, 15 August 2013, Pages 185-196
نویسندگان
, , ,