The challenge of gene expression profiling in heterogeneous clinical samples

تقریبا تمام نمونه هایی که در زیست شناسی تومور استفاده می شود، مانند بافت ها و مایعات بدن، ناهمگن هستند، یعنی از انواع مختلف سلول تشکیل شده است. ارزیابی درجه ناهمگونی در نمونه می تواند دانش ما را در فرآیندهای نظیر انتخاب کلونال و متاستاز افزایش دهد. علاوه بر این، تولید پروفایل های بیان از زیر جمعیت های خاص سلول ها می تواند توابع متمایز آنها را نشان دهد. ناهمگنی بافت نیز یک چالش است، زیرا می تواند تفسیر داده های بیان ژن را مختل کند. این فصل (1) یک مروری مختصر در مورد چگونگی ناهمگونی بر روی داده های پروفایل سازی بیان ژن (2) و روش هایی را که در حال حاضر برای ارزیابی بیومارکرهای رونویسی در جمعیت سلولی ناهمگن است، توصیف می کند.