کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10825969 | 1064692 | 2013 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A proteomics workflow for quantitative and time-resolved analysis of adaptation reactions of internalized bacteria
ترجمه فارسی عنوان
یک گردش کار پروتئومیک برای تجزیه و تحلیل کمی و زمان حل و فصل واکنش های سازگاری باکتری های داخلی است
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
The development of a mass spectrometric workflow for the sensitive identification and quantitation of the kinetics of changes in metaproteomes, or in particular bacterial pathogens after internalization by host cells, is described. This procedure employs three essential stages: (i) SILAC pulse-chase labeling and infection assay; (ii) isolation of bacteria by GFP-assisted cell sorting; (iii) mass spectrometry-based proteome analysis. This approach displays greater sensitivity than techniques relying on conventional cell sorting and protein separation, due to an efficient combination of a filtration-based purification and an on-membrane digestion. We exemplary describe the use of the workflow for the identification and quantitation of the proteome of 106Â cells of Staphylococcus aureus after internalization by S9 human bronchial epithelial cells. With minor modifications, the workflow described can be applied for the characterization of other host-pathogen pairs, permitting identification and quantitation of hundreds of bacterial proteins over a time range of several hours post infection.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 61, Issue 3, 15 June 2013, Pages 244-250
Journal: Methods - Volume 61, Issue 3, 15 June 2013, Pages 244-250
نویسندگان
Henrike Pförtner, Juliane Wagner, Kristin Surmann, Petra Hildebrandt, Sandra Ernst, Jörg Bernhardt, Claudia Schurmann, Melanie Gutjahr, Maren Depke, Ulrike Jehmlich, Vishnu Dhople, Elke Hammer, Leif Steil, Uwe Völker, Frank Schmidt,