Estimating background-subtracted fluorescence transients in calcium imaging experiments: A quantitative approach

تصویربرداری کلسیم در تحقیقات عصب شناختی برای تحقیقات سطح سلولی به سطح شبکه تبدیل شده است. پیشرفت سریع در توسعه شاخص های جدید و تکنیک های تصویربرداری، برای روش های تجزیه و تحلیل قابل اعتماد اختصاص داده شده است. به طور خاص، روشهای کم کردن کارایی و کمی پس انداز فلورسانس پس زمینه برای بسیاری از زمینه تحقیق تصویربرداری کلسیم مفید خواهد بود. بنابراین، روش تخمین گذاری فلوئورسانس پس زمینه که نیازی به اندازه گیری مستقیم مستقل ندارد، توسعه یافته است. این روش بر اساس یک مدل فلورسانس با داده های تک محاکمه با استفاده از رویکرد رگرسیون غیر خطی کلاسیک است. این مدل شامل یک توصیف احتمالی مناسب از سر و صدا سیستم است که منجر به فواصل اطمینان دقیق در تمام مقادیر مورد علاقه (فلورسانس پس زمینه، دوره نرمال شدن پس زمینه فلورسانس پس انداز) زمانی که فلورسانس پس زمینه همگن است. روش اتوماتیک شناسایی ناهماهنگی پس زمینه در داخل منطقه مورد علاقه نیز توسعه یافته است و نشان داده شده است که در داده های شبیه سازی شده کارآمد است. پیاده سازی و اجرای روش پیشنهادی بر روی ضبط های تجربی از هیپوتالاموس ماوس در جزئیات ارائه شده است. این روش که در مورد ضبط بافت های تک سلولی و بافت های رنگ آمیزی استفاده می شود، باید به بهبود مقایسه آماری سیگنال های فلورسانس بین آزمایش ها و مطالعات کمک کند.