Short communication: Analysis of genomic predictor population for Holstein dairy cattle in the United States-Effects of sex and age

افزایش زمان محاسبات برای جمعیت پیش بینی کننده در حال رشد و تسریع ارتباط بین جمعیت اجدادی و حیوانات جاری تبدیل به نگرانی برای سیستم های ارزیابی ژنتیکی شده است. تأثیرات بر قابلیت اطمینان ارزیابی ژنوم ایالات متحده از جمله گاو و گاو نر در جمعیت پیش بینی کننده هولشتاین و نیز حذف گاوهای قدیمی از جمعیت پیش بینی شده مورد بررسی قرار گرفت. داده های هولشتاین برای دسامبر 2013 جمع آوری شده است. ارزیابی ژنوم ایالات متحده در مطالعات برش برای تعیین ضریب اطمینان، ضریب رگرسیون و تعصب برای 5 عملکرد، 3 تناسب اندام، 2 باروری و 18 ویژگی سازگاری مورد استفاده قرار گرفت. سه جمعیت پیش بینی کننده بر اساس جنس حیوانات: 30،852 گاو با ارزیابی های سنتی از اوت 2012، 21،883 گاو با ارزیابی های سنتی از اوت 2012 و گروه ترکیبی از همه گاو و گاو مورد بررسی قرار گرفتند. سه مورد از جمعیت پیش بینی کننده گاوها برای تعیین اثر سن مورد بررسی قرار گرفت: گاوهایی که قبل از سال 1996 متولد شدند (25 درصد از گاوها حذف شدند)، گاوهایی که قبل از سال 2001 متولد شدند (50 درصد) و گاوها قبل از 2005 به دنیا آمد (75 درصد). اعتبار سنجی برای همه جمعیت های پیش بینی کننده گاو یا گاو بود که برای اولین بار از اوت 2012 تا دسامبر 2013 یک ارزیابی سنتی دریافت می کرد. در میان تمام صفات، افزودن گاو به جمعیت پیش بینی کننده گاو، افزایش میزان قابلیت اطمینان به میزان 0.4 درصد برای گاوهای معتبر و 4.4 امتیاز برای گاوهای معتبر در میان تمام صفات، به استثنای گاوهای زده شده قبل از سال 1996 از جمعیت پیش بینی کننده گاوها، دستاوردهای قابلیت اطمینان ژنتیکی 1.8 درصد کاهش یافته است. برای 19 از 28 صفات، به استثنای گوسفندان متولد شده از سال 2005 از جمعیت پیش بینی شده، منجر به تعصب پایین در ارزیابی ژنوم گاوهای اعتبار سنجی شده است. گرچه سهم گاوها و گاوهای سالخورده در بهبود صحت ارزیابی ژنوم ایالات متحده کوچک است، اما رشد اقتصادی قابل دستیابی هنوز به دست نیامده است.