کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10977364 1108048 2013 10 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Mating programs including genomic relationships and dominance effects1
ترجمه فارسی عنوان
برنامه های جفتگیری شامل روابط ژنومی و اثرات غلبه 1
کلمات کلیدی
برنامه جفتگیری رابطه ژنومیک، تسلط، ژنوتیپ،
ترجمه چکیده
برنامه های همکاری متداول با استفاده از اطلاعات ژنوم نیاز به انجمن های نژادی، سازمان های تلقیح مصنوعی و ارائه دهندگان نرم افزار در مزرعه دارند، اما چنین نرم افزاری در حال حاضر با اندازه ماتریس ارتباط چالش برانگیز است. در اکتبر 2012، بیش از 230،000 هولستین از پیش بینی ژنوم در آمریکای شمالی دریافت کردند. روشهای کارآمد نگهداری، محاسبه و انتقال روابط ژنومی از یک پایگاه داده مرکزی به مشتریان از طریق پرسشنامه وب برای تقریبا 165،000 گاو ژنوتیپ و زیر مجموعه ای از 1518 گاو که منشأ آن در آن زمان برای خرید در دسترس بود، توسعه یافت. این مطالعه با استفاده از 3 نژاد، تفاوت در انتخاب شاگردان، روش های اختصاص دادن همسران، استفاده از روابط ژنتیکی یا روابط جنسی و اثر تأثیرات سلطه در یک برنامه جفتگیری را مورد بررسی قرار داد. برای هر دو جوراب و هولستین، برنامه های انتخاب و جفتگیری با استفاده از 50 گاو بازاری که به فروش می رسند برای خالص خالص حیات ژنتیکی و سنتی و همچنین 50 گاو انتخاب شده به صورت تصادفی مورد آزمایش قرار گرفتند. 500 جوانترین گاوهای ژنوتیپ در بزرگترین گله در هر نژاد دارای دو قطعه از همان نژاد با محدودیت 10 گاو در هر گاو و 1 گاو در گاو (فقط 79 گاو و 8 گاو برای براون سوئیس). واریانس غلبه 4/1 و 7/3 درصد برای هولستینز و جیریسس با استفاده از 45،187 مارکر و انحراف گروه مدیریت برای تولید شیر تعیین شد. انتخاب شاگردان به عنوان مهمترین مولفه برای بهبود ارزش نسبی مورد انتظار شناسایی شد و پس از آن مدیریت درختکاری و پس از آن تسلط سلطه. درآمد مربوط به درصد تولید شیر در این مطالعه 64، 27 و 9 برای هولستین ها و 73، 20 و 7 برای جیرجیرک بود. روش برنامهریزی خطی برای اختصاص یک مات به ترتیب انتخاب ترتیب با کاهش زوال ژنومی یا نژاد با 0.86 تا 1.06 و 0.93 به 1.41 به ترتیب. استفاده از ژنوم نسبت به اطلاعات مربوط به رابطه شجرهدار باعث کاهش بیشتر در کشت گاوهای مورد انتظار و به تبع آن بیشتر مقادیر نسبی حاصل شده است. بر اساس ارزش خالص زندگی سالم، ارزش اقتصادی استفاده از روابط ژنومی 3 میلیون دلار در سال برای هولستینها در هنگام استفاده از تمامی زنان ژنوتیپ است، با این فرض که هر یک از آنها یک جایگزین را فراهم می کند. برنامه های مونتاژ قبلی نیاز به انتقال تنها یک پرونده شجره نامه به مشتریان داشتند، اما خدمات بهتر با ترکیب روابط ژنومی، تخصیص دقیق تر همت و اثربخشی سلطه ممکن است. مزایای اقتصادی همچنان رشد خواهد کرد، زیرا بیشتر زنان ژنتیکی هستند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
پیش نمایش مقاله
برنامه های جفتگیری شامل روابط ژنومی و اثرات غلبه 1
چکیده انگلیسی
Computerized mating programs using genomic information are needed by breed associations, artificial-insemination organizations, and on-farm software providers, but such software is already challenged by the size of the relationship matrix. As of October 2012, over 230,000 Holsteins obtained genomic predictions in North America. Efficient methods of storing, computing, and transferring genomic relationships from a central database to customers via a web query were developed for approximately 165,000 genotyped cows and the subset of 1,518 bulls whose semen was available for purchase at that time. This study, utilizing 3 breeds, investigated differences in sire selection, methods of assigning mates, the use of genomic or pedigree relationships, and the effect of including dominance effects in a mating program. For both Jerseys and Holsteins, selection and mating programs were tested using the top 50 marketed bulls for genomic and traditional lifetime net merit as well as 50 randomly selected bulls. The 500 youngest genotyped cows in the largest herd in each breed were assigned mates of the same breed with limits of 10 cows per bull and 1 bull per cow (only 79 cows and 8 bulls for Brown Swiss). A dominance variance of 4.1 and 3.7% was estimated for Holsteins and Jerseys using 45,187 markers and management group deviation for milk yield. Sire selection was identified as the most important component of improving expected progeny value, followed by managing inbreeding and then inclusion of dominance. The respective percentage gains for milk yield in this study were 64, 27, and 9, for Holsteins and 73, 20, and 7 for Jerseys. The linear programming method of assigning a mate outperformed sequential selection by reducing genomic or pedigree inbreeding by 0.86 to 1.06 and 0.93 to 1.41, respectively. Use of genomic over pedigree relationship information provided a larger decrease in expected progeny inbreeding and thus greater expected progeny value. Based on lifetime net merit, the economic value of using genomic relationships was >$3 million per year for Holsteins when applied to all genotyped females, assuming that each will provide 1 replacement. Previous mating programs required transferring only a pedigree file to customers, but better service is possible by incorporating genomic relationships, more precise mate allocation, and dominance effects. Economic benefits will continue to grow as more females are genotyped.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Dairy Science - Volume 96, Issue 12, December 2013, Pages 8014-8023
نویسندگان
, , , , ,