کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
11408161 1496464 2018 8 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Interrogating gut bacterial genomes for discovery of novel carbohydrate degrading enzymes
ترجمه فارسی عنوان
بازجذب ژنوم باکتریایی روده برای کشف آنزیم های تجزیه کننده جدید کربوهیدرات
ترجمه چکیده
باکتری های انسانی انسانی اغلب صدها آنزیم را برای تخریب پلی ساکارید های مختلف سلول می کنند. شناسایی ژن های همجنسگرا و هم تنظیم شده در این باکتری ها، یک رویکرد موفق برای شناسایی آنزیم هایی است که به طور کامل یا بخشی از کربوهیدرات های پیچیده شرکت می کنند، اغلب فعالیت های کاتالیزوری جدید را تشخیص می دهند. در اینجا، مطالعات اخیر را بررسی می کنیم که به کشف فعالیت های جدید از باکتری های روده منجر شده اند و یک طرح عمومی برای شناسایی باکتری های روده ای با توانایی های کاتالیزوری جدید، تشخیص آنزیم های مربوطه و بررسی فعالیت های آنها را در جزئیات خلاصه شده است. استحکام این روش با در دسترس بودن داده های ژنوم و مت ژنومیک فراوان برای میکروبیوم روده انسانی تقویت می شود، که روشی مقطعی را برای داده های موجود در معدن برای آنزیم های جدید یا ارتوپسی آسان می کند.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه شیمی شیمی (عمومی)
چکیده انگلیسی
Individual human gut bacteria often encode hundreds of enzymes for degrading different polysaccharides. Identification of co-localized and co-regulated genes in these bacteria has been a successful approach to identify enzymes that participate in full or partial saccharification of complex carbohydrates, often unmasking novel catalytic activities. Here, we review recent studies that have led to the discovery of new activities from gut bacteria and summarize a general scheme for identifying gut bacteria with novel catalytic abilities, locating the enzymes involved and investigating their activities in detail. The strength of this approach is amplified by the availability of abundant genomic and metagenomic data for the human gut microbiome, which facilitates comparative approaches to mine existing data for new or orthologous enzymes.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Chemical Biology - Volume 47, December 2018, Pages 126-133
نویسندگان
, ,