کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1994091 | 1064734 | 2009 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Constructing atomic-resolution RNA structural ensembles using MD and motionally decoupled NMR RDCs
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
A broad structural landscape often needs to be characterized in order to fully understand how regulatory RNAs perform their biological functions at the atomic level. We present a protocol for visualizing thermally accessible RNA conformations at atomic-resolution and with timescales extending up to milliseconds. The protocol combines molecular dynamics (MD) simulations with experimental residual dipolar couplings (RDCs) measured in partially aligned 13C/15N isotopically enriched elongated RNA samples. The structural ensembles generated in this manner provide insights into RNA dynamics and its role in functionally important transitions.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 49, Issue 2, October 2009, Pages 167–173
Journal: Methods - Volume 49, Issue 2, October 2009, Pages 167–173
نویسندگان
Andrew C. Stelzer, Aaron T. Frank, Maximillian H. Bailor, Ioan Andricioaei, Hashim M. Al-Hashimi,