کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2076556 | 1079453 | 2008 | 4 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Topology and thermodynamics of gaseous ligands diffusion paths in human neuroglobin
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
ریاضیات
مدلسازی و شبیه سازی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The physiological role of recently discovered human neuroglobin (Ngb) is still unknown. Sound hypothesis says that it protects brain during hypoxia. In this paper the advanced potential of mean force by implicit ligand sampling (PMF/ILS) method is used to study the free energy landscape of Ngb for O2, NO and CO ligands. The multiple diffusion paths are discovered and four ligand binding cavities are determined. The data show that certain regions are easily accessible by O2 and NO but are protected from CO. Free energy landscapes provide realistic data for stochastic models of ligand diffusion in proteins.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biosystems - Volume 94, Issue 3, December 2008, Pages 263–266
Journal: Biosystems - Volume 94, Issue 3, December 2008, Pages 263–266
نویسندگان
Slawomir Orlowski, Wieslaw Nowak,