Intraspecific variation in 16S rRNA gene of Mycoplasma synoviae determined by DNA sequencing

Mycoplasma synoviae (MS) is an important avian pathogen may cause both respiratory disease and joint inflammation synovitis in poultry, causing economic losses to the Brazilian poultry industry. The genotypic variation in 16S rRNA gene is unknown. Partial sequences of 16S rRNA gene of 19 strains of M. synoviae were sequenced and analyzed in order to obtain molecular characterization and evaluation of the genetic variability of strains from distinct Brazilian areas of poultry production. Different polymorphic patterns were observed. The number of polymorphic alterations in the studied strains ranged from 0 to 6. The nucleotide variations, including deletion, insertion and substitutions, ranged from 3 to 5. The genotypic diversity observed in this study may be explained by spontaneous mutations that may occur when a lineage remains in the same flock for long periods. The culling and reposition in poultry flocks may be responsible for the entry of new strains in different areas.

RésuméMycoplasma synoviae (MS) est un important agent pathogène aviaire qui peut causer des maladies respiratoires ou des problèmes articulaires comme des synovites, en provoquant des pertes économiques pour ĺindustrie aviaire brésilienne. La variation génotypique dans le gène 16S est méconnue. La séquence partielle du gène rRNA 16S de 19 échantillons de Mycoplasma synoviae a été sequencée et analysée pour obtenir la caractérisation moléculaire et l’analyse de la variabilité génétique des échantillons de différentes régions brésiliennes de production aviaire. Des différentes séquences pléomorphiques ont été observées. Le nombre de modifications pléomorphiques dans les échantillons étudiés a varié de zéro (0) à six (6). Les variations de nucléotides, y compris délétion, insertion et substitutions, ont varié de trois (03) à cinq (05). La diversité génotypique observée dans cette étude peut être expliquée par les mutations spontanées qui peuvent se produire quand l’ascendance se maintient dans le même environnement par une longue période. La sélection et le remplacement dans les lots d’oiseaux peuvent être responsables de l’entrée de nouveaux échantillons dans différents secteurs de production aviaire.