Recent progress in molecular biology of Crimean–Congo hemorrhagic fever

Crimean–Congo hemorrhagic fever (CCHF) is a severe hemorrhagic fever in humans with a case fatality rate of up to 50%. A causative agent of CCHF is CCHF virus, which is a tick-borne virus in the family Bunyaviridae, genus Nairovirus. The virus is transmitted to humans through infected tick bites, squashed ticks or from direct contact with viremic animals or humans. Outbreaks of CCHF have been documented in Africa, the Middle East, Eastern Europe and Western Asia where the vector and/or reservoir ticks of Hyalomma spp. are distributed. Recent advances in molecular and biochemical analyses of CCHF virus revealed that the virus encodes larger proteins compared to other genus of Bunyavirus and the processing of viral proteins are complicated. Recent studies also showed that the CCHF viruses are relatively divergent in its genome sequence and the viruses are grouped in seven different clades. In general, these phylogenetic analyses based on sequences of S-RNA and L-RNA segment of CCHF viruses indicate that the seven clades correlate with their geographical location. The phylogenetic topology based on M-RNA segment sequences of CCHF viruses is different from those based on S-RNA and L-RNA segments. These analyses indicate that M-RNA segment reassortment events occur more frequently than those in S- and L-RNA segments.

RésuméLa fièvre hémorragique de Crimée–Congo (FHCC) est une fièvre hémorragique foudroyante qui s’attaque à l’homme et entraîne la mort dans 50% des cas. L’agent responsable de la FHCC est un virus de type Nairovirus de la famille des Bunyaviridae qui se transmet par les tiques. Ce virus est transmis aux hommes lors de la morsure d’une tique infectée, par une tique écrasée ou par contact direct avec des animaux ou des personnes infecté(e)s. Les tiques Hyalomma spp. ont joué le rôle de vecteur et/ou de réservoir en répandant la FHCC en Afrique, au Moyen Orient, en Europe de l’Est et en Asie occidentale. Les récentes découvertes en matière d’analyses moléculaires et biochimiques sur le virus de la FHCC ont révélé qu’il encodait des protéines plus grosses que celles des autres virus de la famille des Bunyavirus, et que la fabrication des protéines virales était compliqué. De récentes études ont également montré que la séquence génomique des virus de la FHCC était assez différente, et que les virus étaient répartis en sept clades. En général, les analyses phylogénétiques, basées sur des séquences de segment d’ARN court et long des virus de la FHCC, indiquent que les sept clades sont liées à leur situation géographique. La topologie phylogénétique, basée sur les séquences du segment d’ARN moyen des virus de la FHCC, diffère de celle basée sur les segments d’ARN court et long. Ces analyses montrent que les évènements de réassortiment du segment d’ARN moyen se produisent plus fréquemment que ceux des segments d’ARN court et long.