Glycopeptide intermediate Staphylococcus aureus and prevalence of the luk-PV gene in clinical isolates, in Northern Lebanon

ObjectivesThe aim of our study was to confirm the identification of 113 meticillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains by pyrosequencing, to determine the susceptibility of these clinical isolates to various classes of antibiotics, to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) to glycopeptides, and to detect mecA and luk-PV genes.MethodologyThe Staphylococcus species was identified by pyrosequencing of the variable region (V3) of the 16SrRNA. The susceptibility of these 113 strains of MRSA to antibiotics was determined by the disk diffusion method on Mueller-Hinton agar. The MIC of glycopeptides was determined by using the dilution method on solid media. mecA gene and luk-PV gene were detected by PCR.ResultsThe disk diffusion method proved full susceptibility to vancomycin, teicoplanin, and linezolid; whereas MIC (dilution method) indicated that 5/113 strains were resistant to teicoplanin, giving a probability of having heterogeneous glycopeptide intermediate S. aureus (hGISA) strains. The mecA gene was detected in all MRSA strains ruling out the probability of having new variants of this gene in the tested strains. The luk-PV gene was detected in 28 out of 113 MRSA strains (24.8%).ConclusionThe originality of this study was the detection of hGISA strains knowing that they were susceptible to glycopeptides according to the diffusion method. Thus it is necessary to check the level of susceptibility of MRSA clinical isolates to glycopeptides for immunodeficient patients, by determining the MIC.

RésuméObjectifsConfirmer l’identification de 113 souches de Staphylococcus aureus résistante à la méticilline (SARM) par pyroséquencage, déterminer le niveau de sensibilité de ces isolats cliniques à différentes classes d’antibiotiques, déterminer la concentration minimale inhibitrice (CMI) aux glycopeptides, et détecter la présence des gènes mecA et luk-PV.MéthodologieL’identification des espèces de Staphylococcus a été faite par pyroséquencage de la région variable (V3) de l’ARNr16S. La sensibilité des souches aux antibiotiques a été déterminée par la méthode de diffusion des disques sur gélose de Mueller-Hinton. La CMI aux glycopeptides a été déterminée par la méthode de dilution en milieu solide. Les gènes mecA et luk-PV ont été détectés par PCR.RésultatsLa méthode de diffusion des disques a révélé une sensibilité totale aux vancomycine, teicoplanine et linézolide ; alors que la détermination de la CMI (méthode de dilution) a montré que 5/113 souches résistaient à la teicoplanine, donnant une probabilité d’avoir des souches hGISA. Le gène mecA a été détecté chez toutes les souches de SARM, écartant la probabilité d’avoir de nouvelles variantes de ce gène parmi les souches testées. La détection du gène luk-PV a révélé que 28/113 (24,8 %) des souches SARM contenaient ce gène.ConclusionL’originalité de cette étude réside dans la détection des souches hGISA sachant qu’elles étaient sensibles aux glycopeptides par la méthode standard (méthode de diffusion), d’où la nécessité de vérifier le niveau de sensibilité des souches cliniques de SARM aux glycopeptides pour les patients immunodéprimés, par la détermination de CMI.