Epidemiological study of Enterobacteriaceae resistance to colistin in Sfax (Tunisia)

ObjectivesThe authors had for aim to monitor Enterobacteriaceae resistance to colistin, during 6 years (2005–2010), and to study the epidemiology of Enterobacteriaceae resistant strains isolated in the Sfax region (Tunisia).DesignThis retrospective study was carried out in the microbiology laboratory, at the Habib Bourguiba teaching hospital in Sfax. All strains of colistin resistant Enterobacteriaceae isolated from patients were studied.ResultsOne hundred and twenty one strains of colistin resistant Enterobacteriaceae were isolated from 93 patients. Klebsiella pneumoniae was the most frequent species (60.2%), followed by Enterobacter cloacae (26.9%), and Escherichia coli (12.9%). Thirteen strains (E. cloacae) were heteroresistant to colistin. Eighty one isolates (87.1%) were resistant to third generation cephalosporins. The rate of resistance to colistin ranged from 0.09% for E. coli to 1.2% for K. pneumoniae, and 1.5% for E. cloacae. A progressively increasing colistin resistance was observed for K. pneumoniae. Most resistant strains were isolated from urine in the urology department. Previous exposure to colistin was reported in 59.2% of patients. Pulsed field gel electrophoresis typing revealed different clones.ConclusionsColistin resistance in Enterobacteriaceae is a worrying phenomenon in Sfax. It is related to polyclonal diffusion. Continuous epidemiological monitoring and a rational use of colistin are necessary to limit the spreading of these colistin resistant strains and to maintain this antibiotic's effectiveness.

RésuméObjectifsSuivre l’évolution de la résistance à la colistine des entérobactéries au cours de la période 2005 à 2010 et étudier les caractéristiques épidémiologiques des souches résistantes isolées dans la région de Sfax (Tunisie).Matériel et méthodesÉtude rétrospective menée au laboratoire de microbiologie du CHU Habib Bourguiba de Sfax portant sur toutes les souches cliniques d’entérobactéries résistantes à la colistine.RésultatsCent vingt et un souches cliniques d’entérobactéries résistantes à la colistine ont été isolées chez 93 patients. Klebsiella pneumoniae était l’espèce prédominante (60,2 %) suivie par Enterobacter cloacae (26,9 %) et Escherichia coli (12,9 %). Treize souches (E. cloacae) étaient résistantes hétérogènes à la colistine. Quatre-vingt-un souches (87,1 %) étaient résistantes aux céphalosporines de troisième génération. Les taux de la résistance à la colistine étaient de 0,09 % pour E. coli, 1,2 % pour K. pneumoniae et 1,5 % pour E. cloacae. Une augmentation progressive de la résistance a été notée pour K. pneumoniae. La majorité des souches résistantes a été isolée à partir des urines et provenait du service d’urologie. La prise antérieure de colistine a été retrouvée chez 59,2 % des patients. L’étude de la clonalité des souches par PFGE a permis de distinguer des clones différents.ConclusionsLa résistance à la colistine chez les entérobactéries isolées à Sfax est un phénomène inquiétant lié à une diffusion polyclonale. Une surveillance épidémiologique continue et une utilisation rationnelle de la colistine sont nécessaires afin de limiter la diffusion de ces souches résistantes à la colistine et de préserver l’efficacité de cet antibiotique.