La culture et l’antibiogramme de mycobactéries sur automate VersaTREK

RésuméBut de l’étudeLe laboratoire de microbiologie de l’hôpital de Mulhouse s’est équipé d’un système VersaTREK de détection de croissance automatique des mycobactéries, développé par la société TREK Instruments aux États-Unis, distribué en France par Biocentric. Nous évaluons ce système sur les prélèvements analysés d’avril 2009 à mars 2010.MéthodeLe système VersaTREK associe un milieu de culture liquide, un supplément de croissance et pour les échantillons potentiellement contaminés, un supplément antibiotique. La technologie se base sur la détection des modifications de pression dans la partie supérieure d’un flacon fermé en surveillant les modifications dans la production ou la consommation de gaz dues à la croissance microbienne. L’incubation est de 42 jours. Un tube de coletsos est ensemencé en parallèle. Le système a été validé pour tous types de prélèvements et permet la réalisation d’un antibiogramme pour les antituberculeux de première intention.RésultatsLe délai de détection est plus court par rapport à la culture en milieu solide. Le délai moyen de détection des positifs est de 19,1 et 35,6 jours respectivement pour le milieu liquide et le milieu solide. Des prélèvements sont uniquement positifs en milieu liquide (ganglions). L’antibiogramme est obtenu rapidement (six et 13 jours) à partir d’une culture positive. Les techniques d’identification par biologie moléculaire peuvent être réalisées directement à partir d’un échantillon prélevé sur un flacon positif.ConclusionCe système permet un diagnostic plus rapide et est une alternative aux autres automates de culture en milieu liquide existants.

ObjectivesOur laboratory of microbiology use the VersaTREK/ESP Culture System II for the isolation of mycobacteria. In this study, we evaluate this system for the analysis carried out between April 2009 and March 2010.MethodThe Myco bottles are supplemented with growth supplements and an antimicrobial agent solution prior to inoculation with the specimen. The technology of the VersaTREK/ESP Culture System II is based on the detection of headspace pressure changes within a sealed bottle. It monitors changes in either gas production or gas consumption due to microbial growth. A special algorithm has been developed for detection of very slow growing mycobacteria. The bottles are incubated during 42 days. Meanwhile a solid medium is inoculated too. All specimen types can be analysed with this system.ResultsCompared to solid culture, the time needed for detection of positive cultures was significantly shorter for the VersaTREK with a good recovery rate. For isolates recovered in both systems, mean time of detection is respectively 19.1 and 35.6 days for liquid and solid cultures. Mycobacteria identification may be determined using nucleic acid probs directly in Myco VersaTREK or in the solid medium. The susceptibility test of Mycobacteria tuberculosis complex is obtained between six and 13 days for rifampin, isoniazid, ethambutol, streptomycin and pyrasinamide.ConclusionThis system offers a faster diagnosis and is an alternative to other instruments using liquid culture.