Détection de la colonisation nasale de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline : étude prospective comparant l'amplification génique temps réel vs les milieux chromogènes sélectifs

RésuméL'amplification génique temps réel à la différence de l'amplification génique « classique » peut être réalisée dans tous les laboratoires sans recours à des locaux sophistiqués. Elle permet de plus une détection très précoce (deux heures) comparée à la culture. Le but de l'étude est d'évaluer la faisabilité de l'amplification génique temps réel en routine lors d'une étude prospective en comparaison avec les milieux chromogènes.Patients et méthodes. – Cette étude a débuté en juillet 2004 sur une période de quatre mois chez les patients entrant dans quatre services et 682 écouvillons nasaux ont été prélevés chez 508 patients.Résultats. – Soixante-quatre (9,3 %) étaient positifs par amplification génique et par culture (CHROMagar™ MRSA, MRSASelect et/ou ORSAB), 19 (2,9 %) étaient positifs par amplification génique seulement (trois patients étaient sous traitement antibiotique), 572 échantillons étaient négatifs par les deux techniques. La sensibilité et la spécificité de ce test étaient de 95,7 et de 96,8 % respectivement avec une valeur prédictive positive de 70 % et une valeur prédictive négative de 96,6 %. Initialement, 82 échantillons n'ont pas donné de résultat par amplification génique (12 %). Trente-huit d'entre eux ont été résolus à la suite d'un cycle de congélation–décongélation. Au final, 44 échantillons (6,4 %) sont sans résultat d'amplification génique. La comparaison des résultats des cultures montrent une bonne corrélation pour les milieux chromogènes CHROMagar™ MRSA et MRSASelect(positivité à 24 heures de 5,5 et 5,6 % respectivement). Ces deux milieux permettent une meilleure détection à 24 heures par rapport au milieu chromogène ORSAB.Conclusion. – Les résultats obtenus dans cette étude par amplification génique temps réel pour la détection nasale des staphylocoques dorés résistants à la méthicilline sont prometteurs. Malgré 6,4 % d'échantillons dépourvus de résultats par amplification génique nous considérons que le kit IDI-MRSA™ constitue une avancée significative pour la rapidité de la détection des patients colonisés.

In contrast to « classical » genic amplification, real-time genic amplification can be performed in every laboratory without the need of sophisticated isolation procedures. Moreover, real-time genic amplification allows an early detection of meticillin resistant Staphylococcus aureus colonization, 2 hours compared to 1 or 2 days for culture.Objective. – In order to assess the feasibility on Smartcycler® of the IDI-MRSA™ real-time genic amplification assay in comparison with chromogenic media.Methods. – A prospective study has been initiated in July 2004: nasal swabs were taken from patients entering the ICU, vascular surgery, diabetology and geriatry wards. During a 4 months period, 682 specimens have been obtained from 508 patients.Results. – Sixty-four (9.3%) patients were positive by genic amplification and selective agar culture (CHROMagar™ MRSA, MRSASelect and/or ORSAB), 19 (2.9%) were positive by genic amplification only (3 of these patients were under antibiotic treatment); 572 specimens remained negative by both methods. The sensitivity and specificity of this assay were 100% and 96% respectively with a positive predictive value of 70% and negative predictive value of 100%. Initially 82 nasal specimens were unresolved (12%). 38 were resolved following a freeze-thaw cycle. Thus, 44 (6.4%) were unresolved specimens. Comparison between CHROMagar™ MRSA and MRSASelect showed a good correlation for the detection at 24 hours (5.5% and 5.6% respectively). These two chromogenic media allowed a much better detection of MRSA than ORSAB medium within 24H.Conclusion. – The results obtained by the early real-time genic amplification for the detection of meticillin resistant Staphylococcus aureus are promising. Despite 6.4% amplification failure, we consider that IDI-MRSA™ real-time genic amplification assay represents a significant breakthrough in the detection of colonization.