کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4358470 | 1300435 | 2013 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Deep sequencing revealed genome-wide single-nucleotide polymorphism and plasmid content of Erwinia amylovora strains isolated in Middle Atlas, Morocco
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
ایمنی شناسی و میکروب شناسی
میکروبیولوژی و بیوتکنولوژی کاربردی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Erwinia amylovora causes economic losses that affect pear and apple production in Morocco. Here, we report comparative genomics of four Moroccan E. amylovora strains with the European strain CFBP1430 and North-American strain ATCC49946. Analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) revealed genetic homogeneity of Moroccan's strains and their proximity to the European strain CFBP1430. Moreover, the collected sequences allowed the assembly of a 65 kpb plasmid, which is highly similar to the plasmid pEI70 harbored by several European E. amylovora isolates. This plasmid was found in 33% of the 40 E. amylovora strains collected from several host plants in 2009 and 2010 in Morocco.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Research in Microbiology - Volume 164, Issue 8, October 2013, Pages 815–820
Journal: Research in Microbiology - Volume 164, Issue 8, October 2013, Pages 815–820
نویسندگان
Najat Hannou, Samuel Mondy, Sara Planamente, Mohieddine Moumni, Pablo Llop, María López, Charles Manceau, Marie-Anne Barny, Denis Faure,