کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5002095 1368448 2016 5 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Stability of stochastic gene regulatory networks using entropy methods*
ترجمه فارسی عنوان
پایداری شبکه های نظارتی ژن تصادفی با استفاده از روش های آنتروپی *
کلمات کلیدی
مدارهای ژنی، مدل های ریاضی، سیستم های تصادفی روش های آنتروپی، ثبات، دینامیک،
ترجمه چکیده
مطالعه شبکه های بیان ژن خود تنظیم شده باید با استفاده از معادلات مستقل شیمیایی مدل سازی شود. با این حال، راه حل آن در اکثر موارد در دسترس نیست. در این کار، یک مدل دیفرانسیل انتگرالی جزئی به عنوان همپوشانی مداوم یک معادله اصلی با فرآیند پرش به دست می آوریم. این مدل ما را قادر می سازد تا عددی رفتار پویا توزیع پروتئین را که حالت پایدار آن را یک راه حل تحلیلی می پذیرد بازتولید کنیم. برای بررسی همگرایی با تعادل، ما قابلیت کاربرد روش های آنتروپی را بررسی می کنیم. با استفاده از این تکنیک ها، شواهد عددی پایداری نشان می دهد. مشتقات و روش های ارائه شده می تواند کمک به گسترش کاربرد این مدل به پیچیده تر شبکه های نظارتی ژنی از جمله بیش از یک پروتئین باشد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه سایر رشته های مهندسی مکانیک محاسباتی
پیش نمایش مقاله
پایداری شبکه های نظارتی ژن تصادفی با استفاده از روش های آنتروپی *
چکیده انگلیسی
The study of self regulated gene expression networks must be modelled using chemical master equations. However, its solution is not available in the most cases. In this work, we derive a partial integral differential model as the continuous counterpart of one master equation with jump process. This model allows us to reproduce numerically the dynamic behaviour of the protein distribution whose steady state admits an analytical solution. To study the convergence to the equilibrium, we test the applicability of entropy methods. Using these techniques we find numerical evidences of exponential stability. The derivation and methods presented can be of the help to extend the applicability of this model to more complex gene regulatory networks including more than one protein.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: IFAC-PapersOnLine - Volume 49, Issue 24, 2016, Pages 1-5
نویسندگان
, , , ,