کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5002920 | 1368459 | 2016 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Parameter identification in synthetic biological circuits using multi-objective optimization*
ترجمه فارسی عنوان
شناسایی پارامتر در مدارهای بیولوژیکی مصنوعی با استفاده از بهینه سازی چند منظوره *
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
مدارهای بیولوژیک، پارامترهای جنبشی شناسایی پارامتر، بهینه سازی چند هدفه،
ترجمه چکیده
ما روش شناسی مبتنی بر بهینه سازی چند منظوره را برای انجام ارزیابی پارامتر ارائه می کنیم که می تواند به طور کامل به مجموعه ای از مدل های محلی برای مدارهای بیولوژیکی مهار شود. این روش از یک الگوریتم تکاملی چند هدفه ای و یک استراتژی تصمیم گیری چند منظوره برای انتخاب بهترین راه حل ها استفاده می کند. رویکرد ما یک تقریب به پارامتری بهینه مجموعه ای از پارامترهای مدل که هر سناریوی تجربی را نشان می دهد، می یابد. سپس مجموعه پارتو با توجه به سناریوهای تجربی خوشه بندی شد. این، به نوبه خود، اجازه می دهد تا حساسیت پارامترهای مدل برای سناریوهای مختلف را تجزیه و تحلیل کنیم. در نهایت، کاربرد کاربرد روش شناسی را از طریق مطالعه موردی یک مدار منبع تغذیه نامتقارن ژنتیکی تحت غلظت های مختلف سیگنال ورودی القایی نشان می دهد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
سایر رشته های مهندسی
مکانیک محاسباتی
چکیده انگلیسی
We present a methodology based on multi-objective optimization to perform parameter estimation that can fully harness to ensembles of local models for biological circuits. The methodology uses a global multi-objective evolutionary algorithm and a multi-criteria decision making strategy to select the most suitable solutions. Our approach finds an approximation to the Pareto optimal set of model parameters that correspond to each experimental scenario. Then, the Pareto set was clustered according to the experimental scenarios. This, in turn, allows to analyze the sensitivity of model parameters for different scenarios. Finally, we show the methodology applicability through the case study of a genetic incoherent feed-forward circuit, under different concentrations of the inducer input signal.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: IFAC-PapersOnLine - Volume 49, Issue 26, 2016, Pages 77-82
Journal: IFAC-PapersOnLine - Volume 49, Issue 26, 2016, Pages 77-82
نویسندگان
Y. Boada, A. Vignoni, G. Reynoso-Meza, J. Picó,