کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5002926 1368459 2016 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Validation methods for population models of gene expression dynamics
ترجمه فارسی عنوان
روش های اعتبارسنجی برای مدل های جمعیت دینامیک بیان ژن
کلمات کلیدی
روش های آماری، زیستشناسی سیستم، مدل سازی تصادفی، مدل سازی ترکیبی اثر. بیان ژن،
ترجمه چکیده
ظهور تکنیک های تجربی برای نظارت بر زمان بیان ژن در سطح تک سلولی راه را برای مطالعه مبتنی بر مدل تغییرات بیان ژن درون سلول های سراسر سلول گشوده است. تعدادی از رویکردها برای استنتاج مدلهای حسابداری برای تغییرپذیری بیان ژن بر جمعیت سلولی ایزوژنیک توسعه داده شده و به سناریوهای واقعی جهان اعمال شده است. با وجود این، توسعه رویکرد سیستماتیک برای اعتبارسنجی مدلهای جمعیتی عقب مانده است و دقت مدلهای به دست آمده اغلب بر پایه نیمه تجربی ارزیابی می شود. در این مقاله، مسئله اعتبارسنجی مدلهای پویایی شبکه ژن برای جمعیت سلولی، ارائه ابزارهای آماری برای اعتبارسنجی و مقایسه مدل کیفی و کمی، و رهنمودهای کاربرد و تفسیر آنها براساس یک مطالعه موردی بیولوژیکی مورد مطالعه قرار گرفته است.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه سایر رشته های مهندسی مکانیک محاسباتی
پیش نمایش مقاله
روش های اعتبارسنجی برای مدل های جمعیت دینامیک بیان ژن
چکیده انگلیسی
The advent of experimental techniques for the time-course monitoring of gene expression at the single-cell level has paved the way to the model-based study of gene expression variability within- an across-cells. A number of approaches to the inference of models accounting for variability of gene expression over isogenic cell populations have been developed and applied to real-world scenarios. The development of a systematic approach for the validation of population models is however lagging behind, and accuracy of the models obtained is often assessed on a semi-empirical basis. In this paper we study the problem of validating models of gene network dynamics for cell populations, providing statistical tools for qualitative and quantitative model validation and comparison, and guidelines for their application and interpretation based on a real biological case study.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: IFAC-PapersOnLine - Volume 49, Issue 26, 2016, Pages 114-119
نویسندگان
, , ,