کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5510778 1539337 2017 5 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Survey of adaptive biasing potentials: comparisons and outlook
ترجمه فارسی عنوان
بررسی پتانسیل تغییرپذیری سازگاری: مقایسه و چشم انداز
ترجمه چکیده
پتانسیل انحراف پذیری سازگار تبدیل به یک ابزار استاندارد تجارت برای مشکلات شیمی، علوم مواد، زیست شناسی و کشف مواد مخدر است. این روش ها آسان برای استفاده، آسان برای توزیع، قابل اعتماد بودن و امکان شبیه سازی غیر ممکن است. در این بررسی ما تعدادی از پتانسیل های تعادلی تطبیقی ​​را بررسی می کنیم و نگاهی انتقادی به نحوه کار آنها می گذاریم. تعصب ها به دو کلاس پایه تقسیم می شوند که هر کدام ویژگی های مشخص و سطوح پیچیدگی دارند. نکته جالب توجهی که در مورد سوگیری ها مورد بحث قرار گرفته است، تنها در چند سال گذشته ظهور کرده است و اجازه می دهد تا درمان های یکپارچه از تمامی تعصبات را در بر داشته باشد. ما با اظهارات در مورد بهره وری محاسباتی از تعصبات نتیجه می گیریم، که در ادبیات کنونی عمدتا نادیده گرفته شده است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Adaptive biasing potentials are becoming a standard tool of the trade for problems in chemistry, material science, biology, and drug discovery. These methods are easy to use, easy to distribute, reliable, and make otherwise impossible simulations possible. In this review we survey a number of adaptive bias potentials, and take a critical look at how they work. The biases fall into two basic classes, each having distinct attributes and levels of complexity. The vantage point from which the biases are discussed has only emerged in the last couple of years, and allows for a unified treatment of all the biases. We conclude with remarks about computational efficiency of the biases, which is largely overlooked in the current literature.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 43, April 2017, Pages 63-67
نویسندگان
,