کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5510779 1539337 2017 9 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Using simulation to interpret experimental data in terms of protein conformational ensembles
ترجمه فارسی عنوان
با استفاده از شبیه سازی برای تفسیر داده های تجربی از نظر گروه های پروتئینی سازگار
ترجمه چکیده
در محیط بیولوژیکی، پروتئینها مولکولهای پویا هستند که نیاز به توصیف ساختاری گروهی دارند. شبیه سازی دینامیک مولکولی و آزمایشات حالت راه حل، اطلاعات مختصر را به صورت مختصات دقیق اتمی و متوسط ​​یا توزیع خواص ساختاری یا مقادیر مربوطه ارائه می دهند. به تازگی، افزایش در مقیاس زمانی و فضایی نمونه گیری کانونی و مقایسه سازگاری های متنوع تر، به این ترتیب، اهمیت نمونه گیری حوادث نادر را نشان می دهد. هیجان انگیز، روش های جدید بر اساس حداکثر آنتروپی و استنتاج بیزی، امیدوار کننده برای ارائه یک مکانیسم آماری صحیح برای ترکیب داده های تجربی با شبیه سازی های پویایی مولکولی است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
In their biological environment, proteins are dynamic molecules, necessitating an ensemble structural description. Molecular dynamics simulations and solution-state experiments provide complimentary information in the form of atomically detailed coordinates and averaged or distributions of structural properties or related quantities. Recently, increases in the temporal and spatial scale of conformational sampling and comparison of the more diverse conformational ensembles thus generated have revealed the importance of sampling rare events. Excitingly, new methods based on maximum entropy and Bayesian inference are promising to provide a statistically sound mechanism for combining experimental data with molecular dynamics simulations.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 43, April 2017, Pages 79-87
نویسندگان
,