Protein-protein interactions: scoring schemes and binding affinity

تعاملات پروتئین-پروتئینی، می تواند به چندین توابع سلولی کمک کند، که می تواند از اطلاعاتی که به دست آمده از ساختارهای سه بعدی پروتئین-پروتئین ها و داده های وابستگی مرتبط استفاده می شود، درک شود. این بررسی بر روی جنبه های محاسباتی پیش بینی بهترین ساختار پیچیده بومی و وابستگی های مرتبط است. بخش اول، پیش بینی ساختارهای پیچیده پروتئین پروتئین و پروتئین و مزایای جستجو و تساوی سازگاری در پیوند پروتئین-پروتئین را بررسی می کند. بخش دوم به جنبه های مختلف ترمودینامیک تعامل پروتئین و پروتئین، مانند پایگاه های مرتبط با وابستگی های اتصال و دیگر پارامترهای ترمودینامیکی، روش های محاسباتی برای پیش بینی وابستگی اتصال با استفاده از ساختارهای سه بعدی از توالی های پیچیده یا توالی آمینو، و تغییر در وابستگی های اتصال از مجتمع ها بر روی جهش ها. ما آخرین تحولات مربوط به پیوند پروتئین و پروتئین و مطالعات وابستگی پذیری را همراه با لیستی از منابع محاسباتی موجود برای درک اثرات متقابل پروتئین و پروتئین ارائه می کنیم.