کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5510894 1539338 2017 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Principles of protein structural ensemble determination
ترجمه فارسی عنوان
اصول تعیین کننده ساختار پروتئین ساختاری
ترجمه چکیده
عملکرد بیولوژیکی مولکول های پروتئینی به شدت وابسته به دینامیک سازگاری آنها است. این جنبه مخصوصا برای پروتئین های نارسایی است که احتمالا یک سوم پروتئوم انسان را تشکیل می دهد. بنابراین، گروه های ساختاری اغلب نمایانگرهای مفیدتر پروتئین نسبت به ترکیبات فردی هستند. در اینجا، ما توصیف می کنیم که چگونه اصول ثابت شده برای تعیین ساختار پروتئین باید مورد بررسی قرار گیرد. این اصول عمدتا در مورد نحوه برخورد با دولت های متداول ناهمگن و با اندازه گیری های تجربی که بر اساس چنین شرایطی متاثر می شوند و با خطاهای مختلف تحت تاثیر قرار می گیرند، در اولویت قرار دارند. برای اولین بار، ادبیات در حال رشد از روش های اخیر که اطلاعات تجربی و محاسباتی را برای مدل سازی سازه های ساختمانی ترکیب می کنند، مورد توجه قرار گرفته و شباهت ها و تفاوت های آنها را بررسی می کنیم. سپس به برخی از مسائل مفهومی در تعیین گروه های ساختاری می پردازیم و اهداف آینده را در راستای تعیین معیارهای عینی برای مقایسه، اعتبارسنجی، تجسم و انتشار این مجموعه ها تعریف می کنیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
The biological functions of protein molecules are intimately dependent on their conformational dynamics. This aspect is particularly evident for disordered proteins, which constitute perhaps one-third of the human proteome. Therefore, structural ensembles often offer more useful representations of proteins than individual conformations. Here, we describe how the well-established principles of protein structure determination should be extended to the case of protein structural ensembles determination. These principles concern primarily how to deal with conformationally heterogeneous states, and with experimental measurements that are averaged over such states and affected by a variety of errors. We first review the growing literature of recent methods that combine experimental and computational information to model structural ensembles, highlighting their similarities and differences. We then address some conceptual problems in the determination of structural ensembles and define future goals towards the establishment of objective criteria for the comparison, validation, visualization and dissemination of such ensembles.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 42, February 2017, Pages 106-116
نویسندگان
, , , ,