کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5513476 | 1541208 | 2017 | 17 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Optimization of PAR-CLIP for transcriptome-wide identification of binding sites of RNA-binding proteins
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Photoactivatable-Ribonucleoside-Enhanced Crosslinking and Immunoprecipitation (PAR-CLIP) in combination with next-generation sequencing is a powerful method for identifying endogenous targets of RNA-binding proteins (RBPs). Depending on the characteristics of each RBP, key steps in the PAR-CLIP procedure must be optimized. Here we present a comprehensive step-by-step PAR-CLIP protocol with detailed explanations of the critical steps. Furthermore, we report the application of a new PAR-CLIP data analysis pipeline to three distinct RBPs targeting different annotation categories of cellular RNAs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volumes 118â119, 15 April 2017, Pages 24-40
Journal: Methods - Volumes 118â119, 15 April 2017, Pages 24-40
نویسندگان
Aitor Garzia, Cindy Meyer, Pavel Morozov, Marcin Sajek, Thomas Tuschl,