کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5513479 | 1541208 | 2017 | 32 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Computational analysis of CLIP-seq data
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Although peak calling is often the final step in many CLIP-seq publications, an important follow-up task is the determination of binding models from CLIP-seq data. This is central because CLIP-seq experiments are highly dependent on the transcriptional state of the cell in which the experiment was performed. Thus, relying solely on binding sites determined by CLIP-seq from different cells or conditions can lead to a high false negative rate. This shortcoming can, however, be circumvented by applying models that predict additional putative binding sites.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volumes 118â119, 15 April 2017, Pages 60-72
Journal: Methods - Volumes 118â119, 15 April 2017, Pages 60-72
نویسندگان
Michael Uhl, Torsten Houwaart, Gianluca Corrado, Patrick R. Wright, Rolf Backofen,