کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5542012 1402513 2017 5 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Short communication: The role of genotypes from animals without phenotypes in single-step genomic evaluations
ترجمه فارسی عنوان
ارتباط کوتاه: نقش ژنوتیپ از حیوانات بدون فنوتیپ ها در ارزیابی ژنوم تک مرحله ای
ترجمه چکیده
در سیستم ژنومی 2 مرحله ای، ژنوتیپ های حیوانات بدون فنوتیپ بر پیش بینی ژنوم حیوانات دیگر تاثیر نمی گذارد، اما ممکن است در سیستم های تک مرحله ای مورد استفاده قرار نگیرد. ما اثرات شامل ژنوتیپ ها از گاوهای مورد نظر را بر پایایی پیش بینی ژنومی از ارقام تک مرحله بررسی کردیم. چهار سناریو با مقدار ثابت اطلاعات فنوتیپی و افزایش تعداد ژنوتیپ ها از گاوهای کشت شده شبیه سازی شده و با توجه به قابلیت اطمینان پیش بینی شده مقایسه شده است. با افزایش تعداد گاوهای کشت شده ژنوتیپ، افزایش قابل توجهی در قابلیت اطمینان پیش بینی وجود دارد. به عنوان مثال، در سناریوی شبیه سازی ما، اطمینان برای انتخاب نامزدها دو برابر بزرگتر بود، زمانی که همه گاو نر از 4 نسل گذشته در تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. ارزیابی های تک مرحله ای مستلزم محکومیت همه حیوانات نابالغ در حیوانات می باشد. ما نشان دادیم که این محاسبه به طور فزاینده ای دقیق تر شده است، زیرا اطلاعات ژنتیکی بیشتری از گاوهای مورد نظر به طور فزاینده ای مورد توجه قرار گرفته است. این باعث افزایش اعتماد به نفس پیش بینی شده است. میزان استفاده از ژنوتایپ ها از گاوهای کشت شده ممکن است برای جمعیت های کوچک با سطوح کم اعتماد به نفس بیشتر باشد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
چکیده انگلیسی
In a 2-step genomic system, genotypes of animals without phenotypes do not influence genomic prediction of other animals, but that might not be the case in single-step systems. We investigated the effects of including genotypes from culled bulls on the reliability of genomic predictions from single-step evaluations. Four scenarios with a constant amount of phenotypic information and increasing numbers of genotypes from culled bulls were simulated and compared with respect to prediction reliability. With increasing numbers of genotyped culled bulls, there was a corresponding increase in prediction reliability. For instance, in our simulation scenario the reliability for selection candidates was twice as large when all culled bulls from the last 4 generations were included in the analysis. Single-step evaluations imply the imputation of all nongenotyped animals in the pedigree. We showed that this imputation was increasingly more accurate as increasingly more genotypic information from the culled bulls was taken into account. This resulted in higher prediction reliabilities. The extent of the benefit from including genotypes from culled bulls might be more relevant for small populations with low levels of reliabilities.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Dairy Science - Volume 100, Issue 10, October 2017, Pages 8277-8281
نویسندگان
, , , , , ,