کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5905278 | 1159870 | 2015 | 34 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The complete mitochondrial genome of Brachymystax lenok tsinlingensis (Salmoninae, Salmonidae) and its intraspecific variation
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
rRNASalmonidaeETASPCGstRNACSBND6DNA - DNA یا اسید دزوکسی ریبونوکلئیکBLAST, basic local alignment search tool - ابزار پایهای برای جستجوی برهم نهیهای موضعی، بلاستBlast - انفجارconserved sequence block - بلوک توالی محافظت شدهReplication origin - تکثیر منشاءbase pair - جفت پایهkilo base pair - جفت پایه کیلوMaximum-likelihood method - روش حداکثر احتمالControl region - منطقه کنترلpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازprotein coding genes - ژن های کد کننده پروتئینMitochondrial genome - ژنوم میتوکندریابی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The Manchurian trout, Brachymystax lenok tsinlingensis, is endangered in Korea, where the southern range limit for this cold-freshwater fish occurs. In this study, the complete mitochondrial genome of Korean B. lenok tsinlingensis was sequenced and its genetic characteristics were identified. The mitogenome of B. lenok tsinlingensis comprises 16,748 base pairs containing 37 genes (13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, and 2 rRNA genes) and one major non-coding region (control region), making it similar to the majority of vertebrate mitogenomes. Interestingly, at the base of the stem region of OL in B. lenok tsinlingensis, the conserved motif is replaced by a 5â²-ACCGG-3â² motif instead of the 5â²-GCCGG-3â². We also identified an 81-base-pair tandem-repeat motif in the control region, the length of which is reduced by one nucleotide compared to those in B. lenok and Hucho species. The number of repeat motifs differed between Korean and Chinese B. lenok tsinlingensis, with two and three reiterations, respectively. The control region of B. lenok and its relatives will be used as a genetic marker in evolution/genetic studies and as a PCR-based marker for rapid identification of their lineages.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 573, Issue 2, 1 December 2015, Pages 246-253
Journal: Gene - Volume 573, Issue 2, 1 December 2015, Pages 246-253
نویسندگان
Jeong-Nam Yu, Myounghai Kwak,