کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5914087 | 1162720 | 2013 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Web-based visualisation and analysis of 3D electron-microscopy data from EMDB and PDB
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
OMEFSCPDBOAV3DEMEMDBOmeroElectron Microscopy Data Bank - بانک اطلاعات میکروسکوپ الکترونیVisualisation - تجسمElectron tomography - توموگرافی الکترونیMacromolecular structure - ساختار مغناطیسیElectron microscopy - میکروسکوپ الکترونیThree-dimensional electron microscopy - میکروسکوپ الکترونی سه بعدیFourier shell correlation - همبستگی پوسته فوریهProtein Data Bank - پروتئین بانک اطلاعاتی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شناسی مولکولی
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
The Protein Data Bank in Europe (PDBe) has developed web-based tools for the visualisation and analysis of 3D electron microscopy (3DEM) structures in the Electron Microscopy Data Bank (EMDB) and Protein Data Bank (PDB). The tools include: (1) a volume viewer for 3D visualisation of maps, tomograms and models, (2) a slice viewer for inspecting 2D slices of tomographic reconstructions, and (3) visual analysis pages to facilitate analysis and validation of maps, tomograms and models. These tools were designed to help non-experts and experts alike to get some insight into the content and assess the quality of 3DEM structures in EMDB and PDB without the need to install specialised software or to download large amounts of data from these archives. The technical challenges encountered in developing these tools, as well as the more general considerations when making archived data available to the user community through a web interface, are discussed.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 184, Issue 2, November 2013, Pages 173-181
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 184, Issue 2, November 2013, Pages 173-181
نویسندگان
Ingvar Lagerstedt, William J. Moore, Ardan Patwardhan, Eduardo Sanz-GarcÃa, Christoph Best, Jason R. Swedlow, Gerard J. Kleywegt,