کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5914543 | 1162741 | 2012 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
D-CAT: Density and Clustering Annotation Tool for three dimensional electron microscopic volumes
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شناسی مولکولی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: D-CAT: Density and Clustering Annotation Tool for three dimensional electron microscopic volumes D-CAT: Density and Clustering Annotation Tool for three dimensional electron microscopic volumes](/preview/png/5914543.png)
چکیده انگلیسی
Three dimensional (3D) electron microscopy techniques have become valuable tools for investigating cellular architecture and the processes that govern it. A vast amount of information is available in every 3D tomogram but the options for presenting this information in a clear and visually appealing way are limited. To address this, we developed D-CAT; a MatLab-application to accurately visualize the distribution of membrane proteins and/or membrane-bound structures. Presence (density) and distribution (clustering, depletion) are presented as color-coded areas on membranes. By using IMOD models both as input and output format, we ensure that the application fits within workflows common in the field of 3D electron microscopy.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 177, Issue 2, February 2012, Pages 571-577
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 177, Issue 2, February 2012, Pages 571-577
نویسندگان
M.N. Lebbink, L.H.P. Hekking, W.J.C. Geerts, J.A. Post,