کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6120166 | 1592357 | 2015 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The use of next generation sequencing in the diagnosis and typing of respiratory infections
ترجمه فارسی عنوان
استفاده از توالی نسل بعدی در تشخیص و تایپ عفونت های تنفسی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
HCoVTRTIFAHEVVTMAdVNGShMPVRT-PCRRSVViral transport mediumHRV - ENGNPs - NP هاAdenovirus - آدنوویروسcycle threshold - آستانه چرخهInfluenza B - آنفلوآنزا BInfluenza A - آنفلوانزا ABLAST, basic local alignment search tool - ابزار پایهای برای جستجوی برهم نهیهای موضعی، بلاستHuman enterovirus - انتروویروس انسانیhuman coronavirus - انسان کرونا ویروسBlast - انفجارDiagnostics - تشخیصVirus detection - تشخیص ویروسNext generation sequencing - توالی نسل بعدیHuman rhinovirus - رینوویروس انسانیTurn-around time - زمان چرخشNasopharyngeal swab - سواب نازوفارنکسviral respiratory infection - عفونت تنفسی ویروسیreal-time polymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمراز واقعی در زمان واقعیRespiratory syncytial virus - ویروس سنسیتیال تنفسیHuman metapneumovirus - ویروس متاپومومای انسانی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
ایمنی شناسی و میکروب شناسی
میکروبیولوژی و بیوتکنولوژی کاربردی
چکیده انگلیسی
Target independent NGS can detect viral pathogens in clinical samples. Where viruses were detected by RT-PCR alone the Ct value was higher than those detected by both assays, suggesting an NGS detection cut-off - Ct = 32. The sensitivity and specificity of NGS compared with RT-PCR was 78% and 80% respectively. This is lower than current diagnostic assays but NGS provided full genome sequences in some cases, allowing determination of viral subtype and serotype. Sequencing technology is improving rapidly and it is likely that within a short period of time sequencing depth will increase in-turn improving test sensitivity.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Clinical Virology - Volume 69, August 2015, Pages 96-100
Journal: Journal of Clinical Virology - Volume 69, August 2015, Pages 96-100
نویسندگان
Fiona Thorburn, Susan Bennett, Sejal Modha, David Murdoch, Rory Gunson, Pablo R. Murcia,