کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6872886 | 1440625 | 2018 | 38 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Low-power portable devices for metagenomics analysis: Fog computing makes bioinformatics ready for the Internet of Things
ترجمه فارسی عنوان
دستگاه های قابل حمل کم قدرت برای تجزیه و تحلیل مت ژنومیک: محاسبات رواناب، بیوانفورماتیک را برای اینترنت چیزهای آماده می کند
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نظریه محاسباتی و ریاضیات
چکیده انگلیسی
Portable sequencing machines, such as the Oxford Nanopore MinION, are making the genome sequencing ubiquitous. This can be particularly interesting for identifying specific bacteria in air-filters or waters and for monitoring the microbioma composition in cultivated soils or in different animal samples, using a simple and portable approach. However, a main problem of these portable sequencing devices is that they stream huge amounts of data, which management can be actually challenging. Low-power System-on-Chip architectures represent a feasible way for designing a solution, based on the Fog computing paradigm, for processing locally the raw data, considering both the base calling step and the genome alignment part, and for sending only meaningful results over Internet. Cloud services can be then used to collect and integrate results in a Internet of Things framework, in order to trigger notifications or alarms and, in perspective, for more sophisticated applications based on statistical or machine learning approaches.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Future Generation Computer Systems - Volume 88, November 2018, Pages 467-478
Journal: Future Generation Computer Systems - Volume 88, November 2018, Pages 467-478
نویسندگان
Ivan Merelli, Lucia Morganti, Elena Corni, Carmelo Pellegrino, Daniele Cesini, Luca Roverelli, Gabriele Zereik, Daniele D'Agostino,