کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
7070653 1459927 2016 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Deeper insight into the structure of the anaerobic digestion microbial community; the biogas microbiome database is expanded with 157 new genomes
ترجمه فارسی عنوان
بینش عمیق تر به ساختار جامعه میکروبی هضم بی هوازی؛ پایگاه داده های میکروبیوم بیوگاز با 157 ژنوم جدید گسترش می یابد
ترجمه چکیده
این تحقیق به منظور مشخص نمودن میکروبیوم بیوگاز با استفاده از توالی فرآوری بالا برای متان ژنوم و تشریح کنسرسیوم میکروبی هسته موجود در راکتورهای بیوگاز به طور مستقل از شرایط عملیاتی است. مونتاژ تفنگ ساچمهای با توجه به استراتژی پیوند ایجاد شده، منجر به بالاترین میزان استخراج ژنوم های میکروبی در سیستم های تولید بیوگاز می شود. از 236 سطل زباله ژنوم استخراج شده، به طرز قابل توجهی می توان دریافت که اکثریت قریب به اتفاق آنها فقط در سطوح تاکسونومیکی بالا مشخص می شود. این نتیجه تایید می کند که میکروبیوم بیوگاز توسط یک کنسرسیومی از گونه های ناشناخته تشکیل شده است. تجزیه و تحلیل تطبیقی ​​بین سطل های ژنوم مطالعه فعلی و کسانی که استخراج شده از یک مونت ژن مگنومیک قبلی نشان دادند، توزیع فیلوژنتیک مشابهی از تاکسون های اصلی را نشان می دهد. در نهایت، این تجزیه و تحلیل منجر به شناسایی یک زیرمجموعه از میکروب های رایج که می تواند به عنوان گروه ضروری هسته در تولید بیوگاز در نظر گرفته شود.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی شیمی تکنولوژی و شیمی فرآیندی
چکیده انگلیسی
This research aimed to better characterize the biogas microbiome by means of high throughput metagenomic sequencing and to elucidate the core microbial consortium existing in biogas reactors independently from the operational conditions. Assembly of shotgun reads followed by an established binning strategy resulted in the highest, up to now, extraction of microbial genomes involved in biogas producing systems. From the 236 extracted genome bins, it was remarkably found that the vast majority of them could only be characterized at high taxonomic levels. This result confirms that the biogas microbiome is comprised by a consortium of unknown species. A comparative analysis between the genome bins of the current study and those extracted from a previous metagenomic assembly demonstrated a similar phylogenetic distribution of the main taxa. Finally, this analysis led to the identification of a subset of common microbes that could be considered as the core essential group in biogas production.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Bioresource Technology - Volume 216, September 2016, Pages 260-266
نویسندگان
, , , , ,