کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
7377939 1480121 2016 10 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Analysis of amino acids network based on distance matrix
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل شبکه اسیدهای آمینه بر اساس ماتریس فاصله
کلمات کلیدی
آمینو اسید، کدون، اندازه گیری مرکزیت، ضریب خوشه بندی، ماتریس فاصله،
ترجمه چکیده
در این مقاله ما یک ماتریس فاصله اسیدهای آمینه را ساخته ایم. فاصله براساس اهمیت تکاملی نسبی موقعیت پایه کدونهای مربوطه تعریف شده است. از این ماتریس فاصله یک شبکه اسیدهای آمینه به دست می آید. ما استدلال کرده ایم که این شبکه الگوی تکاملی اسید آمینه را نشان می دهد. برای بررسی اهمیت نسبی اسید آمینه در ارتباط با این شبکه، ما در مورد اندازه گیری های متمرکز مورد بحث قرار گرفته ایم. ما همچنین ضرایب همبستگی بین اندازه های مختلف مرکزیت را مورد بررسی قرار داده ایم. علاوه بر این، ما ضریب خوشه بندی و همچنین میزان توزیع را مورد بررسی قرار داده ایم.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه ریاضیات فیزیک ریاضی
پیش نمایش مقاله
تجزیه و تحلیل شبکه اسیدهای آمینه بر اساس ماتریس فاصله
چکیده انگلیسی
In this paper we have constructed a distance matrix of the amino acids. The distance is defined based on the relative evolutionary importance of the base position of the corresponding codons. From this distance matrix a network of the amino acids is obtained. We have argued that this network depicts the evolutionary pattern of the amino acids. To examine the relative importance of the amino acids with respect to this network we have discussed different measures of centrality. We have also investigated the correlation coefficients between different measures of centrality. Further we have explored clustering coefficient as well as degree of distribution.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications - Volume 452, 15 June 2016, Pages 69-78
نویسندگان
, , ,