Cryptic binding sites on proteins: definition, detection, and druggability

بسیاری از پروتئین ها در ساختارهای غیرمتعارف دارای جیب های سطح مناسب برای اتصال دارو نیستند. از این رو، انواع ابزارهای تجربی و محاسباتی برای شناسایی سایت های رمزنگاری که در پروتئین غیرمتمرکز آشکار نیستند، اما از اتصال لیگاند ​​آشکار شده اند و می توانند مکان های هدفمند مواد مخدر را مهار کنند. هدف این بررسی بحث درباره تعریف، تشخیص و درمان این سایت ها و ارزش بالقوه آنها برای کشف مواد مخدر است. روش های نوین مبتنی بر شبیه سازی دینامیک مولکولی به ویژه امیدوار کننده و تعداد زیادی از جیب های گذرا هستند، اما نشان داده شده است که تنها یک اقلیت از این سایت ها به طور کلی قادر به اتصال لیگاند با ارتباطات قابل توجهی است. بر اساس مطالعات اخیر، روش های فعلی را می توان با ترکیب دینامیک مولکولی با استفاده از دوخت قطعات و روش های یادگیری ماشین بهبود داد.