کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8319449 1539331 2018 10 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
New developments in force fields for biomolecular simulations
ترجمه فارسی عنوان
تحولات جدید در زمینه های نیروی شبیه سازی بیوموکلئر
ترجمه چکیده
توسعه میدان نیروی بیومولکولی در بهبود توان پیش بینی شبیه سازی مولکولی در طی چهار دهه گذشته نقش مهمی ایفا کرده است. اخیرا، دوران مجموعه داده های آزمایشی کمی تجربی و قدرت محاسباتی با کارایی بالا، سرعت پیشرفت در این زمینه را افزایش داده است. در این بررسی ما پیشرفت های اخیر پروتئین های مختلف اتمی، اسید نوکلئیک و مولکول های کوچک را خلاصه می کنیم و توجه خاصی به پیشرفت در روش های پارامترها و بهبود در بازنمایی های تعاملات غیرمستقیم که برای حل مشکلات بیوفیزیکی در حال حاضر در حال حاضر مهم هستند . ما همچنین راه های جدیدی را برای توسعه میدان نیروی و برنامه های بزرگ چالش برای آینده نزدیک طرح می کنیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Biomolecular force field development has been instrumental in improving the predictive power of molecular simulations over the past four decades. More recently, the era of large quantitative experimental datasets and ubiquitous high performance computing power has enabled rapid progress in the field. In this review we summarize recent developments in all-atom protein, nucleic acid, and small molecule force fields, paying specific attention to developments in parameterization methods and improvements in the representations of nonbonded interactions that are critical for solving the challenging biophysical problems of the present. We also sketch out new avenues for force field development and grand challenge applications for the near future.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 49, April 2018, Pages 129-138
نویسندگان
, ,