Computational approaches to investigating allostery

تنظیم آلوستریک نقش کلیدی بسیاری از فرآیندهای بیولوژیکی مانند انتقال سیگنال، تنظیمات رونویسی و بسیاری موارد دیگر را ایفا می کند. این ریشه در خواص ترمودینامیکی و پویایی سیستم های ماکرومولکولی است که هنوز ضعیف درک شده اند و علاوه بر آن در زمینه سلول نیز مدول شده اند. در اینجا ما روشی محاسباتی مورد استفاده در بررسی پروسس های آلوستریک در سیستم های پروتئین را بررسی می کنیم. ما چگونگی شکل گیری الستروسها از شکل گیری اولیه آنها در شصت سالگی تا دیدگاه های فعلی، که بیشتر به نقش خواص ترمودینامیکی و پویای سیستم بستگی دارد، پرداخته شده است. ما سپس دسته های اصلی روش های محاسباتی را برای توضیح مکانیزم های آلوستری، بینش های ارائه شده و همچنین محدودیت های آنها توصیف می کنیم. ما این تحلیل را با تأکید بر نقش رویکردهای محاسباتی در برنامه های کاربردی عملی، مانند مهندسی مؤلفه های نظارتی و شناسایی سایت های پیوند آلوستریک، تکمیل می کنیم.