Novel function discovery through sequence and structural data mining

داده های توالی و ساختاری در مقیاس وسیع طلا از پروتئین های جدید است، اما چگونه می توان این داده ها را به طور موثر برای توابع جدید استخراج کرد؟ در اینجا، ما روش پیش بینی عملکرد پروتئین و مطالعات اخیر را بررسی می کنیم که این روش ها را برای کشف قابلیت های جدید کاربرد می دهد. رویکردهای هسته شامل تشخیص هماهنگی مبتنی بر دنباله، تجزیه فیلوژنتیک، بیوانفورماتیک ساختاری و استنتاج انجمن های کاربردی با استفاده از زمینه ژنتیکی و روش های مرتبط است. با چنین طیف گسترده ای از رویکردها، توالی ها ممکن است قابلیت های جدید را بدون در نظر گرفتن شباهتشان با مرجع مشخص نشان دهند. همولوگهای عملکرد شناخته شده ممکن است در گونه های غیر منتظره یا انجمن ها شناسایی شوند. تشخیص تغییرات عملکردی در دنباله ممکن است فعالیت ها و ویژگی های جدید را نشان دهد. توالی پروتئین های جدید نیز ممکن است در توالی ها و ساختار های مشخص نشده پیش بینی شود. در نهایت، روش ها و داده ها می توانند در مقیاس به طور فزاینده ای با توجه به پیشرفت دانش پروتئین و پوشش ساختاری، که توانایی پیش بینی و کشف توابع پروتئینی جدید را تقویت می کند، یکپارچه شده و به کار گرفته شوند.