کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8319725 1539343 2016 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Modeling the effect of pathogenic mutations on the conformational landscape of protein kinases
ترجمه فارسی عنوان
مدل سازی اثر جهش های پاتوژن بر چشم انداز کانونی پروتئین کیناز
ترجمه چکیده
اکثر پروتئین ها برای پیاده سازی توابع سلولی خود، متفاوت هستند. این دینامیک سازگاری فیزیولوژیکی توسط رویدادهای اتصال و اصلاحات پس از ترجمه تنظیم می شود، اما همچنین می تواند تحت تاثیر جهش های بیماریزا قرار گیرد. شبیه سازی های دینامیکی مولکولی اتمی، تکمیل شده با رویکردهای نمونه گیری پیشرفته، به طور فزاینده ای برای بررسی اثر جهش ها بر دینامیک سازگار و بر پایه انرژی تجربی انرژی آزاد پروتئین ها مورد استفاده قرار می گیرد. در این بررسی کوتاه، ما در مورد نمونه های موفق اخیر از شبیه سازی هایی که برای درک مکانیزم مولکولی در زمینه کاهش مقررات پویایی فیزیولوژیکی سازمانی به دلیل موتاساهای تک نقطه ای غیرممکن است، مورد بحث قرار می گیریم. نمونه های ما بیشتر از خانواده پروتئین کیناز است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Most proteins assume different conformations to perform their cellular functions. This conformational dynamics is physiologically regulated by binding events and post-translational modifications, but can also be affected by pathogenic mutations. Atomistic molecular dynamics simulations complemented by enhanced sampling approaches are increasingly used to probe the effect of mutations on the conformational dynamics and on the underlying conformational free energy landscape of proteins. In this short review we discuss recent successful examples of simulations used to understand the molecular mechanism underlying the deregulation of physiological conformational dynamics due to non-synonymous single point mutations. Our examples are mostly drawn from the protein kinase family.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 37, April 2016, Pages 108-114
نویسندگان
, ,