Using the folding landscapes of proteins to understand protein function

پروتئین ها به دلیل یک منظره انرژی شکل قیف در یک زمان زیست شناختی مرتبط می شوند. این چشم انداز از طریق تکامل با استفاده از توالی آمینو اسید است که تثبیت تعاملات بومی در حالی که سرکوب تعاملات پایدار غیر بومی که در طول تاشو رخ می دهد، مجددا تکامل یافته است. با این حال، انتخاب قوی تکاملی برای باقی مانده های عملکردی وجود دارد و نمی توان آنها را برای بهینه سازی تاشو انتخاب کرد. حضور آنها به طرق گوناگون به چشم انداز انرژی تاشو تاثیر می گذارد. در اینجا، ما با ارائه چندین نمونه، اثرات مانده های عملکردی را بر روی تاشو بررسی می کنیم. سپس ما بررسی می کنیم که چگونه چنین اثرات را می توان با استفاده از محاسبات تشخیص داد و به عنوان آزمون برای عملکرد پروتئین استفاده شود. به طور کلی، درک اینکه چگونه باقی مانده های عملکردی تاخیر را مدوله می کنند، باید بینشی راجع به طراحی پروتئین های طبیعی و هوموتازیست خود داشته باشند.