کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8319950 | 1539348 | 2015 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Template-based prediction of protein function
ترجمه فارسی عنوان
پیش بینی الگو از عملکرد پروتئین بر اساس الگو
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
ترجمه چکیده
ما در مورد روش های اخیر برای حاشیه نویسی عملکردهای پروتئینی ساختاری بحث می کنیم. ما بر روی روش های مبتنی بر الگو تمرکز می کنیم که در آن عملکرد یک پروتکل پرس وجو از آن الگو است که هر دو ساختار و عملکرد شناخته شده است. ما روش های مختلف شناسایی یک الگو را توصیف می کنیم. اینها معمولا بر اساس تجزیه و تحلیل توالی است اما روشهای جدید مبتنی بر شباهت صرفا ساختاری نیز در حال توسعه هستند که اجازه می دهد حاشیه نویسی تابع براساس روابط ساختاری باشد که نمی توانند با توالی شناخته شوند. تعداد روزافزون ساختارهای موجود در عملکرد شناخته شده، تکنیک های مدل سازی هماهنگی و پیشرفت های جدید در استفاده از ساختار، امکان استفاده از روش های مبتنی بر الگو را در مقیاس پروتئوم و در بسیاری از زمینه های مختلف بیولوژیکی دارد. این پیشرفت به طرز قابل ملاحظهای دامنه کاربرد اطلاعات ساختاری در تگنویات عملکرد را به سطحی که قبلا تنها با مقایسه توالی قابل دستیابی بود گسترش داد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
We discuss recent approaches for structure-based protein function annotation. We focus on template-based methods where the function of a query protein is deduced from that of a template for which both the structure and function are known. We describe the different ways of identifying a template. These are typically based on sequence analysis but new methods based on purely structural similarity are also being developed that allow function annotation based on structural relationships that cannot be recognized by sequence. The growing number of available structures of known function, improved homology modeling techniques and new developments in the use of structure allow template-based methods to be applied on a proteome-wide scale and in many different biological contexts. This progress significantly expands the range of applicability of structural information in function annotation to a level that previously was only achievable by sequence comparison.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 32, June 2015, Pages 33-38
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 32, June 2015, Pages 33-38
نویسندگان
Donald Petrey, T Scott Chen, Lei Deng, Jose Ignacio Garzon, Howook Hwang, Gorka Lasso, Hunjoong Lee, Antonina Silkov, Barry Honig,