کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8319973 1539350 2015 8 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Allostery without a conformational change? Revisiting the paradigm
ترجمه فارسی عنوان
آلوستریا بدون تغییرات فکری؟ بازبینی پارادایم
ترجمه چکیده
به طور کلاسیک، آلوستری یک سوئیچ کاربردی را از طریق یک تغییر سازنده تغییر می دهد. با این حال، به تازگی تعداد بیشتری از مطالعات نتیجه گیری کرده اند که آلستستری که مشاهده می کنند، از طریق پویایی محض است. در اینجا ما توضیح می دهیم که حتی اگر یک مقایسه ساختاری بین حالت های فعال و غیر فعال یک تغییر سازنده را شناسایی نمی کند، این بدان معنا نیست که هیچ تغییر سازنده ای وجود ندارد. ما دلایل احتمالی این عدم مشاهده، از جمله شرایط کریستالیزاسیون و اثرات کریستال را فهرست می کنیم؛ یکی از حالت ها اختلال است مقایسه ساختاری ساختار پروتئین چهارگانه را نادیده می گیرد؛ با توجه به اثرات همکاری در بین سازنده های آلوزستریکس و سوئیچ های درجه بندی شده و شبیه سازی دینامیک مولکولی بیش از حد کوتاه. توابع خاص با سازگاری های متمایز انجام می شود؛ آنها از طریق تعاملات ویژه ای بین دولت های انتخابی متضاد ظاهر می شوند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Classically, allostery induces a functional switch through a conformational change. However, lately an increasing number of studies concluded that the allostery they observe takes place through sheer dynamics. Here we explain that even if a structural comparison between the active and inactive states does not detect a conformational change, it does not mean that there is no conformational change. We list likely reasons for this lack of observation, including crystallization conditions and crystal effects; one of the states is disordered; the structural comparisons disregard the quaternary protein structure; overlooking synergy effects among allosteric effectors and graded incremental switches and too short molecular dynamics simulations. Specific functions are performed by distinct conformations; they emerge through specific interactions between conformationally selected states.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 30, February 2015, Pages 17-24
نویسندگان
, ,