کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8320222 1539356 2014 14 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Template-based structure modeling of protein-protein interactions
ترجمه فارسی عنوان
مدلسازی ساختار مبتنی بر الگوهای متقابل پروتئین-پروتئین
ترجمه چکیده
ساختار پروتئین-پروتئین ها می تواند با استفاده از ساختار شناخته شده دیگر پروتئین ها به عنوان یک الگو ساخته شود. الگوهای ساختار پیچیده به طور کلی توسط هماهنگ سازی توالی های توالی یا با توجه به ساختار مولفه های مونومر، با مقایسه های مبتنی بر ساختار، تشخیص داده می شوند. پیشرفت های حیاتی در سال های اخیر با استفاده از شناسایی رابط و با ترکیب مجدد مونومر و کتابخانه های قالب پیچیده صورت گرفته است. تشویق پیشرفت نیز در برنامه های کاربردی ژنوم مدل سازی مبتنی بر الگو، با دقت مدل سازی قابل مقایسه با داده های تجربی با کارایی بالا شاهد بوده است. با این وجود، تنگناها به علت ناقص بودن کتابخانه ساختار پیچیده پروتئین-پروتئین و عدم وجود روش های شناسایی الگوهای همولوگ و شناسایی کامل و کامل ساختار پیچیده ای وجود دارد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
The structure of protein-protein complexes can be constructed by using the known structure of other protein complexes as a template. The complex structure templates are generally detected either by homology-based sequence alignments or, given the structure of monomer components, by structure-based comparisons. Critical improvements have been made in recent years by utilizing interface recognition and by recombining monomer and complex template libraries. Encouraging progress has also been witnessed in genome-wide applications of template-based modeling, with modeling accuracy comparable to high-throughput experimental data. Nevertheless, bottlenecks exist due to the incompleteness of the protein-protein complex structure library and the lack of methods for distant homologous template identification and full-length complex structure refinement.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Structural Biology - Volume 24, February 2014, Pages 10-23
نویسندگان
, ,