کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340088 | 1541192 | 2018 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Isolation of mammalian stress granule cores for RNA-Seq analysis
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Stress granules are dynamic, conserved non-translating RNA-protein assemblies that form during cellular stress and are related to pathological aggregates in many neurodegenerative diseases. Mammalian stress granules contain stable structures, referred to as “cores” that can be biochemically purified. Herein, we describe a step-by-step guide on how to isolate RNA from stress granule cores for RNA-Seq analysis. We also describe a methodology for validating the RNA-Seq results by single molecule FISH and how to quantify the single molecule FISH results. These protocols provide a starting point for describing the RNA content of stress granules and may assist in the discovery of the assembly mechanisms and functions of stress granules in a variety of biological contexts.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 137, 15 March 2018, Pages 49-54
Journal: Methods - Volume 137, 15 March 2018, Pages 49-54
نویسندگان
Anthony Khong, Saumya Jain, Tyler Matheny, Joshua R. Wheeler, Roy Parker,