Protein-protein interaction predictions using text mining methods

فراتر از هر گونه شک و تردید است که پروتئین ها و تعاملات آنها نقش مهمی در فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده ایفا می کنند. درک عملکرد آنها به صورت جداگانه، بلکه در قالب پروتئین ها از اهمیت زیادی برخوردار است. امروزه، علیرغم فراوانی روش های مختلف تجربی با کارایی بالا برای تشخیص متابولیسم پروتئین و پروتئین، بسیاری از روش های محاسباتی با هدف پیش بینی تعاملات جدید به نظر می رسد و به دست آورده اند. در این بررسی ما روی متدولوژیهای محاسباتی مبتنی بر متن، با هدف استخراج اطلاعات برای پروتئین ها و تعاملات آنها از مخازن عمومی مانند ادبیات و پایگاه های داده های زیستی مختلف تمرکز می کنیم. ما در مورد نقاط قوت، نقاط ضعف آنها و چگونگی تکمیل تکنیک های تجربی موجود در آنها، با هم اظهار نظر در مورد پایگاه های بیولوژیکی که چنین اطلاعاتی را دارند و مجموعه داده های معیار که می توانند برای ارزیابی ابزارهای جدید استفاده شوند، مورد بحث قرار می گیرند.