کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340712 | 1541250 | 2015 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Assessment of curated phenotype mining in neuropsychiatric disorder literature
ترجمه فارسی عنوان
ارزیابی استخراج فنوتیپ سرطانی در ادبیات اختلالات روانپزشکی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
بر اساس تخصص بالینی ما در پنج بیماری اختلالات نوروژنیک و ثروت از اطلاعات کتابشناختی در مورد اختلالات روانپزشکی، ما یک منبع برای ایجاد ارتباط بین ژن ها، مواد شیمیایی، فنوتیپ در مجموع 31 اختلال ایجاد کرده ایم. یک گام اولیه متا مشتعل کردن خودکار متن ادبیات مربوط به 31 اختلال، هزاران اصطلاح غنی شده را بازگرداند. شرایط کمتر فنوتیپی مرتبط به صورت دستی توسط متخصصان بالینی مطابق با پنج اختلال عصبی از تخصص آنها انتخاب شده و برای تجزیه و تحلیل مجموعه کامل اختلالات مورد استفاده قرار می گیرد. تجزیه و تحلیل داده ها نشان می دهد که روابط کلی بین اختلالات روانپزشکی، که می تواند مورد استفاده قرار گیرد برای طبقه بندی و توصیف آنها. تجزیه و تحلیل همبستگی ما را قادر به پیشنهاد ترکیب جدید از ژن ها و داروهای با اختلالات است. به طور کلی، نتایج به ما منجر شد تا مکانیزم های بیماری را تشخیص دهیم که چندین اختلالات روانپزشکی را شامل می شوند، به عنوان مثال، ژن هایی که مربوط به انتقال سیناپسی و توالی گیرنده هستند، در بسیاری از اختلالات دخیل هستند، در حالی که ژن های مربوط به ادراک حسی و عملکرد حمل کانال اختلالات کمتر. تحقیقات ما نشان می دهد که از طریق تخصص مجموعه ای محدود از اختلالات عصبی و استفاده از روش های متن و داده کاوی، ارتباطات معنی دار و مرتبط با ژن ها، مواد شیمیایی و فنوتیپ ها را می توان برای یک مجموعه گسترده ای از اختلالات روانپزشکی مشتق شده است. نتایج ما برای پزشکان در نظر گرفته شده است تا به آنها کمک کند تا بیماران را ارزیابی کنند و دانشمندان پایه برای ارائه اهداف جدید ژن برای درمان های دارویی. این استراتژی را می توان به تقریبا تمام بیماری ها گسترش داد و از مطالب روزافزون ادبیات زیست پزشکی استفاده می کند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Based on our clinical expertise on five neurodegenerative disorders, and from the wealth of bibliographical data on neuropsychiatric disorders, we have built a resource to infer associations between genes, chemicals, phenotypes for a total of 31 disorders. An initial step of automated text mining of the literature related to 31 disorders returned thousands of enriched terms. Fewer relevant phenotypic terms were manually selected by clinicians as relevant to the five neural disorders of their expertise and used to analyze the complete set of disorders. Analysis of the data indicates general relationships between neuropsychiatric disorders, which can be used to classify and characterize them. Correlation analyses allowed us to propose novel associations of genes and drugs with disorders. More generally, the results led us to uncovering mechanisms of disease that span multiple neuropsychiatric disorders, for example that genes related to synaptic transmission and receptor functions tend to be involved in many disorders, whereas genes related to sensory perception and channel transport functions are associated with fewer disorders. Our study shows that starting from expertise covering a limited set of neurological disorders and using text and data mining methods, meaningful and novel associations regarding genes, chemicals and phenotypes can be derived for an expanded set of neuropsychiatric disorders. Our results are intended for clinicians to help them evaluate patients, and for basic scientists to propose new gene targets for drug therapies. This strategy can be extended to virtually all diseases and takes advantage of the ever increasing amount of biomedical literature.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 74, 1 March 2015, Pages 90-96
Journal: Methods - Volume 74, 1 March 2015, Pages 90-96
نویسندگان
Jean-Fred Fontaine, Josef Priller, Eike Spruth, Carol Perez-Iratxeta, Miguel A. Andrade-Navarro,