کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340719 | 1541251 | 2015 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Neuroinformatics of the Allen Mouse Brain Connectivity Atlas
ترجمه فارسی عنوان
عصب شناسی مغز آلن آلپ اتصال
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
MIPeGFPWaxholm spaceIDPWHSSTP - PTSDigital atlas - اطلس دیجیتالMRI - امآرآی یا تصویرسازی تشدید مغناطیسیImage registration - انطباق تصویر یا ثبت تصویرSignal detection - تشخیص سیگنالMagnetic resonance imaging - تصویربرداری رزونانس مغناطیسیtwo dimensional - دو بعدیZAP - زاپthree dimensional - سه بعدیMaximum Intensity Projection - طرح حداکثر شدتenhanced green fluorescent protein - پروتئین فلورسنت سبز افزایش یافته است
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
The Allen Mouse Brain Connectivity Atlas is a mesoscale whole brain axonal projection atlas of the C57Bl/6J mouse brain. Anatomical trajectories throughout the brain were mapped into a common 3D space using a standardized platform to generate a comprehensive and quantitative database of inter-areal and cell-type-specific projections. This connectivity atlas has several desirable features, including brain-wide coverage, validated and versatile experimental techniques, a single standardized data format, a quantifiable and integrated neuroinformatics resource, and an open-access public online database (http://connectivity.brain-map.org/). Meaningful informatics data quantification and comparison is key to effective use and interpretation of connectome data. This relies on successful definition of a high fidelity atlas template and framework, mapping precision of raw data sets into the 3D reference framework, accurate signal detection and quantitative connection strength algorithms, and effective presentation in an integrated online application. Here we describe key informatics pipeline steps in the creation of the Allen Mouse Brain Connectivity Atlas and include basic application use cases.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 73, February 2015, Pages 4-17
Journal: Methods - Volume 73, February 2015, Pages 4-17
نویسندگان
Leonard Kuan, Yang Li, Chris Lau, David Feng, Amy Bernard, Susan M. Sunkin, Hongkui Zeng, Chinh Dang, Michael Hawrylycz, Lydia Ng,